“对不起，旺卡先生，我要留在这里，就算给我再多巧克力也没用。”
小男孩查理家境贫寒，他和爸爸妈妈、爷爷奶奶、外公外婆生活在一个摇摇欲坠的小屋子里。一家人仅靠着父亲在牙膏厂上班得来的微薄工资过活，生活十分拮据，每天晚上只能喝着菜汤。但就是这样一家人，在简简单单的小屋里生活的格外融洽、温暖。家人的团结、乐观影响着小男孩查理，使他逐渐成长为一个善良、纯真和谦卑的孩子。物质上的贫穷并没有磨灭掉精神上的富有。
相反，威利旺卡却有着“难过”的童年。身为牙科医生的父亲为了保护他的牙齿而禁止他吃糖，给他戴上了极其夸张的牙齿矫正器。父亲过度的行为使可怜的旺卡迫不得已离家出走，出于对父亲的抗拒而创立了自己的巧克力工厂。他没有家人，却有非凡的成就。
这一天，威利旺卡寻找继承人（只能是小孩子），在巧克力的内包装里随机放了五张金奖券运往全球各地进行销售。而这五位幸运儿中将有一人成为巧克力工厂继承人，前提是通过种种考验。
这个神奇的工厂，更像一座有着巨大的魔力的城堡吸引着小朋友们，也吸引着他们那小脑袋瓜里正在生长的欲望。
第一个孩子是奥古斯塔格卢普。他是一个胖男孩，暴发户的儿子，整天暴饮暴食。因为贪吃掉进了巧克力河流里。第一个被淘汰出局。
第二个孩子是维鲁卡索尔特，工厂厂主的女儿。她嚣张跋扈，凡是她想要的东西，必须得到。她来到果仁间，看见松鼠在剥果仁，便命令爸爸给她抓一只松鼠，结果被松鼠们当作一颗坏坚果扔进垃圾桶。第二个被淘汰出局。
第三个孩子是紫罗兰博雷加德。她是一个练跆拳道的女孩，超级自信，狂妄自大，也是所谓的“嚼口香糖冠军”。她在发明室里试吃一枚神奇口香糖的时候，不听旺卡劝告，结果变成了一个超级大的蓝莓球。第三个被淘汰出局。
第四个孩子是麦克帝维。他是个智商超级高的孩子，也是凭借着精准的计算得到了金奖券，却酷爱暴力游戏。他智商的优越间接导致了他缺乏童心，最终被困在电视机里。第四个被淘汰出局。
最后只剩下查理，显然他赢了。但旺卡提出必须抛弃家人才能继承巧克力工厂，查理听到后立即拒绝。对于小查理而言，家人才是最重要的！是多少巧克力都换不来的。当威利旺卡听到查理的话，很惊讶，也很奇怪，他不明白查理为什么宁可不要巧克力工厂也要守护家人。
“糖果向来是我唯一确定的东西，现在我却一点也不确定了”。他不知道自己接下来该做什么味道的糖果，开始自我怀疑。他一直是想做什么就做什么，但即使做了他想要的糖果，却依然很沮丧。
“你沮丧时，要怎么样心情才能变好？”
“和家人在一起！”
“他们成天规定你可以怎样，不可以怎样，这样会扼杀创意的。”
“他们只是想保护你，因为他们爱你。不相信就自己回去问！”
当威利旺卡再次躺在父亲的手术台上时，父亲看着一口完美的牙齿，随即认出了自己的儿子。虽然父亲对旺卡格外的严厉，多少也是出于他的身份，他不仅是位父亲，也是位牙医。在这些年里，父亲把有关旺卡的报道精心裁剪后挂满了墙壁，原来父亲一直深爱着他。而当父亲看到旺卡完美的牙齿时，原来一直以来抗拒父亲的旺卡其实也一直未曾忘记父亲的话，谨记于心。父子二人最终重归于好。
最后，查理得到了巧克力工厂，而威利旺卡也得到了更好的礼物，那就是家人！
有一件事可以非常确定，甜美的人生不过如此！有很多时候，家人只是想保护你，因为他们爱你，可能保护的方式有些奇怪亦或是偏激。我们应该给予理解，而不是抛弃他们。矛盾是暂时的，但终有一天一切都会重归于好！
