一种利用numpy快速获取“二维矩阵中一个点到其余点距离矩阵”的计算方法


需求的提出:

在利用numpy进行图像频域滤波,其中一步需要获取fshift矩阵中心点到矩阵其余各点的直线距离。书本上基本用双层for循环实现,这样对于一个解释性语言来说简直就是噩梦!这让我非常不爽!!!


寻求解决:

我上网搜寻方案,浏览器翻了5页也没找到,只能放弃寻找,自己想办法。


分析问题:

问题:

求一个二维矩阵中某一点到其余各点距离的同形矩阵。

分析:

在二维矩阵中每个点都可以用(x ,y)表示,一共两个数,能不能分开计算呢?好像可以!

二维空间的欧式距离的计算公式就是把x和y分开计算的。我们可以再把矩阵的 行 和 列 拆成 两个 一维向量序列 把中心点拆成 x y,利 用numpy的广播机制,实现快速计算,如下演示:

  (x[:] - x0)^2      (y[:] - y0)^2

再利用numpy 的维度扩增函数,对两条向量进行维度扩充,再利用numpy 广播加法 就能得到一个完整的二维矩阵,进而对矩阵进行开方,得到某一点对其余点的完整距离矩阵。这样就能大幅提高计算速度,避免使用双层for循环。


验证方法:

根据上述思路,初步实现设想代码,如下:

import numpy as np
h,w = 6, 6 # src mat shape
tmp = [np.arange(h), np.arange(w)] 
center = -0.5 + np.array([h, w])/2
dis_mat = (np.expand_dims((tmp[0] - center[0])**2, axis=1)
         + np.expand_dims((tmp[1] - center[1])**2,axis=0))**0.5

print("tmp:\n",tmp, end='\n\n')
print("center:\n", center, end='\n\n')
print("dis_mat:\n", dis_mat)

实验结果:

Example.png

由上图可以看出,我们得到了以原矩阵正中心到其他点距离的同形矩阵。


解决问题:

例:

数字图像处理的频域滤波中常用的ButterWorth 高频滤波实验。

环境:

|AMD-R7-4800u | Win10-21H2 | WSL2 | Ubuntu-20.04LTS | 中使用Vscode for jupyternotebook 运行代码。必要库:numpy、skimage、pyplot、time 。

验证方式:

通过在函数执行部分嵌入记录代码,记录操作完成需要的时间并打印。

原书ButterworthHFilter函数代码:
def butterworthPassFilter(img, d, n):
    import numpy as np
    from math import sqrt 
    start = time.time()
    f = np.fft.fft2(img)
    fshift = np.fft.fftshift(f)
    d_mat = np.zeros(img.shape)
    center = tuple(map(lambda x:(x-1)/2, fshift.shape))
    for i in range(d_mat.shape[0]):
        for j in range(d_mat.shape[1]):
            dis = sqrt((center[0]-i)**2 + (center[1]-j)**2)
            d_mat[i, j] = 1/(1+(d/(dis+1e-6))**(2*n))
    new_img = np.abs(np.fft.ifft2(np.fft.ifftshift(fshift*d_mat)))    
    end = time.time()
    print(end - start)
    return new_img
本人改良ButterworthHFilter函数代码:
def butterworthPassFilter(img, d, n):
    import numpy as np
    start = time.time()
    f = np.fft.fft2(img)
    fshift = np.fft.fftshift(f)
    tmp = [np.arange(fshift.shape[0]),np.arange(fshift.shape[1])]
    center = -0.5 + np.array([fshift.shape[0], fshift.shape[1]])/2.0
    dis = (np.expand_dims((tmp[0] - center[0])**2, axis=1)
         + np.expand_dims((tmp[1] - center[1])**2, axis=0))**0.5

    d_mat = 1/(1+(d/(dis+1e-6))**(2*n))          # Butterworth 高通滤波
    new_img = np.abs(np.fft.ifft2(np.fft.ifftshift(fshift*d_mat)))
    end = time.time()
    print(end - start)
    return new_img
调用代码:
from matplotlib import pyplot as plt
from skimage import io, color
import time

img = io.imread('../medium/images/9.png')
img = color.rgb2gray(img)

plt.subplot(221)
plt.axis('off')
plt.title('Src')
plt.imshow(img, cmap='gray')

plt.subplot(222)
plt.axis('off')
plt.title('Butter 10 1')
butter = butterworthPassFilter(img, 10, 1)
plt.imshow(butter, cmap='gray')

plt.subplot(223)
plt.axis('off')
plt.title('Butter 30 1')
butter = butterworthPassFilter(img, 30, 1)
plt.imshow(butter, cmap='gray')

plt.subplot(224)
plt.axis('off')
plt.title('Butter 10 5')
butter = butterworthPassFilter(img,10, 5)
plt.imshow(butter, cmap='gray')

plt.show()

实验结果

原书双层for循环:
losers.png
本人改良版:
superfast.png

结果分析:

在与原书代码运行时间相比,运行速度平均提升可超5倍多!!!
由此可见利用numpy进行矩阵运算优化的效果非常好!


注意:

文章为本人在简书平台原创,盗用必究!

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