R包学习（dplyr为例）

R包是一系列函数的合集，安装加载R包后可以通过调用别人写好的函数完成自己的数据处理需求

R包安装

R包的来源有R的官网（设置CRAN）和bioconductor这两个网站，下载R包也是从这两个网站上下载的，所以需要先设置镜像，镜像设置不好的话R包下载就会报错

镜像设置

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源

options：设置R的选项设置
查询镜像来源的代码：
options()$repos
options()$BioC_mirror

安装

install.packages(“包”)#CRAN的包
BiocManager::install(“包”)#Bioconductor的包

加载

library()
require()

dplyr包

安装并加载dplyr

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

五个基础函数

mutate()#增加列
select()#筛选列
filter()#筛选行
arrange()#按列排序整个表格
summarise()

实用技能

1、管道

%>% #快捷键(cmd/ctr + shift + M)

2、count 统计某列的unique值

count(test,Species)

dplyr的双表操作

1、内连接

inner_join(A,B,by = 'C')

2、左连接

left_join(A,B,by ='C')

3、全连接

full_join(A,B,by ='C')

4、半连接

semi_join(x = A, y = B, by = 'C')

5、反连接

anti_join(x = A, y = B, by = 'x')

6、简单合并

bind_rows(A,B)
bind_cols(A,B)