100天生信-Day7
ChIP-seq拉下来的reads经过mapping生成.sam文件，sam文件使用samtools转bam，再sort，，最终的bam文件再去跑MACS2 callpeaks。并且可能会建立bam和genom索引去使用IGV可视化
## sam转bam
samtools view -bS Ta.sam > Ta.bam
##sort bam
samtools Ta.bam Ta.sort.bam
## 查看bam文件, 通过管道符输入到less工具查看
samtools view Ta.sort.bam | less -S
## 建立索引，导入IGV(bam,genome)
samtools index Ta..bam
samtools faidx Ta.fa
