Summary of Glioma & scRNA-seq-1

杀杀

[1] Review
Dissecting human gliomas by single-cell RNA sequencing

PMID: 29016805

胶质瘤的瘤内异质性很大程度影响了治疗和复发,已经在2016年被修订的WHO胶质瘤分类指南中,已经讨论了早年一直存在的分型之一的“少支星型胶质瘤”,这种分型由于在组织学观察中显示了少支细胞和星型细胞的两种形态,并且两种形态的占比难以判定,因此被分类为一种混合型的实体。即便是被分类为“少支胶质细胞瘤”,或“星型胶质细胞瘤”,也不可避免地混合存在其它类型的细胞。这种情况导致了治疗的时候无法针对性地治疗某一种胶质瘤亚型。除此之外,胶质瘤中混有的干细胞/祖细胞也很难被靶向。这些都导致了治疗后朝更恶性的方向复发的潜在可能性。

大脑是一个较为复杂的器官,当然不止由胶质细胞构成,一个神经单元内包含了许多其它的细胞和物质,构成了大脑内的微环境,而血脑屏障隔离了大脑与人体血液循环,并通过血脑屏障特定的功能完成大脑和人体营养的交换。因此,胶质瘤的发生除了跟单个细胞的功能相关,还和大脑内其它细胞的互相作用相关。
PMID: 26590417

这篇综述对影响胶质瘤发生/进展的因素总结为:
(i) Genetic alterations drive cellular transformation and the evolution of cancer cells;
(ii) cellular lineages and their associated developmental pathways and epigenetic programs ascribe cancer cells with key phenotypic and functional features; programs such as those of neural stem/progenitor cells, oligodendrocyte progenitor cells, and mature glial cells (astrocytic, oligodendrocytic, ependymal) strongly influence cancer cell behavior;
(iii) diverse nonmalignant cells, including microglia, macrophages, lymphocytes, endothelial, and other cells—collectively forming the tumor microenvironment (TME)—further influence glioma biology and response to therapy.

因此,单细胞的研究十分必要,单细胞研究除了能够分析胶质瘤的瘤内异质性,研究肿瘤发生的时序,还能够对除了胶质瘤细胞外的其它细胞进行分析,阐明影响胶质瘤发生发展、复发的因素。

单细胞测序的一般流程:
Single-cell DNA or RNA profiling of tumors is conceptually similar to bulk profiling, with few important differences.
First, tumor samples are acutely disaggregated into single-cell suspension using a combination of mechanical and enzymatic digestion protocols.
Second, individual cells are separated either by flow cytometry into 96/384-well plates or by microfluidic devices into distinct chambers (eg, by Fluidigm C1) or droplets (eg, in Drop-Seq, In-Drop, or 10X platforms before they are profiled).

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 220,367评论 6 512
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 93,959评论 3 396
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 166,750评论 0 357
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 59,226评论 1 295
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 68,252评论 6 397
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 51,975评论 1 308
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 40,592评论 3 420
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 39,497评论 0 276
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 46,027评论 1 319
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 38,147评论 3 340
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 40,274评论 1 352
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 35,953评论 5 347
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 41,623评论 3 331
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 32,143评论 0 23
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 33,260评论 1 272
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 48,607评论 3 375
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 45,271评论 2 358

推荐阅读更多精彩内容

  • 今天感恩节哎,感谢一直在我身边的亲朋好友。感恩相遇!感恩不离不弃。 中午开了第一次的党会,身份的转变要...
    迷月闪星情阅读 10,567评论 0 11
  • 彩排完,天已黑
    刘凯书法阅读 4,220评论 1 3
  • 没事就多看看书,因为腹有诗书气自华,读书万卷始通神。没事就多出去旅游,别因为没钱而找借口,因为只要你省吃俭用,来...
    向阳之心阅读 4,789评论 3 11
  • 表情是什么,我认为表情就是表现出来的情绪。表情可以传达很多信息。高兴了当然就笑了,难过就哭了。两者是相互影响密不可...
    Persistenc_6aea阅读 125,224评论 2 7