特别鸣谢：@公众号：生信星球 豆豆&花花

R语言基础

软件下载

虽然下边的两个软件都需要下载，但平时使用界面更友好的Rstudio就足够了。

• R
  根据自己电脑的系统，选择对应版本下载。安装过程so easy，谁装谁知道🤔
• Rstudio
  选择free的Rstudio Desktop版本下载即可。

注意：电脑用户名必须是英文，否则无法安装Rstudio😱啧啧啧，就是这么傲娇~

新收入囊中的R命令

• 显示文件列表：dir() / list.files()
• 删除变量：rm(var) / rm(var1,var2,...) / rm(list=ls()) #清空全部变量
• 列出历史命令： history()
• 清空控制台：ctrl+l #小写字母l

ggplot2作图

图1是用ggplot2内置的mpg数据框生成。

#安装ggplot2包
install.packages("ggplot2") 
#激活ggplot2
library(ggplot2) 
#查看mpg数据框
?mpg 
#作图
ggplot(data=mpg) +
  geom_bar(mapping=aes(x=manufacturer,fill=class),
           position="identity",
           alpha=0.4) +
  coord_flip()

图1 直方图

图2还需要加载maps包。

#安装maps包
install.packages("maps") 
#激活maps
library(maps) 
#作图
ggplot(data=map_data("nz")) +
  geom_polygon(
    mapping=aes(x=long, y=lat, group=group),
    fill="pink",
    color="blue"
  ) +
  coord_quickmap()

图2 地图

以上就是今天学到的部分新内容。