构建系统进化树

如何绘制下图所示的基因进化树

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实例

以绵羊的NPPC基因为例绘制不同物种间的进化树
1.首先利用NCBI查找NPPC的蛋白序列

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2.利用NCBI网站对NPPC蛋白进行blast分析
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3.将蛋白序列粘贴至搜索框进行分析，分析后的结果如下，可以选择自己感兴趣的物种进行物种分析
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下载fasta(aligned sequence)
4.下载后将文件后缀名修改为fasta，此为mega识别的蛋白序列文件
image.png

直接拖入到mega进行分析
image.png

在对蛋白序列进行分析之前需要对开头了结尾未对齐的序列进行裁剪，完后点击data中的phylogenetic analysis进行分析。
5.分析
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利用phylogeny 中的NJ法对蛋白序列进行对比。
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即可获得系统进化树。
如需进一步美化，可导出后在AI中进行修改，如何绘制好看的环状进化树？ (qq.com)

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