Align GVGD软件基因突变效应预测只能预测单个氨基酸发生变化的突变。这里以Wnt1 基因的基因突变来具体说明。
一、获取wnt1基因的蛋白序列
1.进入 NCBI 主页https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，选择protein数据库，输入Wnt1 点击search
2.筛选出人类wnt1基因蛋白信息
在页面中找到Top
Organisms栏，选择homo sapiens，并点击
3.获取FASTA格式的人类Wnt1 蛋白序列
在页面中选中人类Wnt1的信息，点击FASTA（一般经过筛选后，所得结果中前面几个会有所需要的蛋白质信息）
4.复制FASTA格式的人类Wnt1 蛋白序列
新建文本文档“wnt1蛋白质序列”，将页面中的序列信息复制到文本文档“wnt1蛋白质序列”中，保存
二、Align GVGD软件基因突变效应预测
1.进入Align GVGD软件官网：http://agvgd.hci.utah.edu/agvgd_input.php
2.在第一个红色标记处点击选择文件，选择文本文档“Wnt1蛋白质序列”，在第二个红色标记处将文本文档“wnt1氨基酸改变”的内容复制到输入框内，点击submit。
3. Align GVGD软件基因突变效应结果
在页面中Prediction即为预测结果，新建“Align GVGD软件wnt1基因突变致病性预测结果”Excel文件，表头依次为DNA change Protein Substitution GV GD Prediction，将结果输入保存。
