法一:
安装:
sudo apt install mysql-client-core-5.7
sudo apt install mariadb-client-core-10.1
下载:
mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -D mm10 -e 'select chrom,chromStart,chromEnd,name from nestedRepeats where repClass="LINE" ' > line1.bed
查看:

ref: https://www.biostars.org/p/127759/
法二:

查看:

ref:UCSC Genome Browser Public Support › LINE
比较下选择第二个mm10:

验证:


有的时候网速不好一定要检查文件完整性!

在igv中查看:
