转录组分析流程
转录组分析总体流程如图所示,主要分为上游分析(原始数据质量控制、比对、组装、定量),下游分析(差异分析、富集分析)和高级分析(共表达分析、GSEA、时序性分析等)。整个流程图左侧为结构分析(SNV分析、可变剪切分析、差异外显子分析(DEU)及新转录本鉴定),右侧主要为基因表达分析。
随后的文章都是使用GSE176393(SRP323246)进行。
跟上我的脚步一起学习吧!
转录组分析总体流程如图所示,主要分为上游分析(原始数据质量控制、比对、组装、定量),下游分析(差异分析、富集分析)和高级分析(共表达分析、GSEA、时序性分析等)。整个流程图左侧为结构分析(SNV分析、可变剪切分析、差异外显子分析(DEU)及新转录本鉴定),右侧主要为基因表达分析。
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