R语言自定义坐标轴排序

        R语言作图时，默认情况下软件会按照自己的方式对坐标轴的项目进行排序，然而这种排序往往不是我们所希望的，因此需要想办法让坐标轴的项目按照我们希望的顺序输出。

        如下所示，我有两列数据，要绘制箱线图，以第一列为Y轴，第二列为X轴，希望X轴的输出顺序按照第二列由上到下排列。

size    type

6.612309456    T-8

5.878857613    T-10

6.724282265    T-15

5.68136692    T-56

5.863334656    T-1723

然而软件输出的顺序如下：

T-10    T-15    T-1723    T-56    T-8

解决方案：

通过一个因子事先自定义X轴顺序，作图命令如下：

#读入数据

gsize <- read.delim("gsize.txt", header=TRUE, sep="\t", stringsAsFactors=FALSE)

#自定义X轴顺序

x1 = factor(gsize$type, levels=c("T-8","T-10","T-15","T-56","T-1723"))

#用x1代替gsize$type绘图

boxplot(size~x1, data=gsize, xlab="Sequence Type", ylab="Genome Size", varwidth=TRUE, notch=FALSE)

至此，X轴各项目会按照我们自定义的顺序排列。