问题 12. 为什么我可视化基因结构,只看到一堆黑线?

问题

TBtools 提供了我自认为 全网最简便易用的 本地基因结构可视化工具。目前也有一定的用户。但是有时候会遇到这样的问题。


解决

事实上,很多参数都已经提供了。但是有部分用户仍然不知道如何更好地使用。
上述问题很简单,用户要一次性展示600多个基因的基因结构。。。。很久以前,我一次性展示数十个物种的1200+个基因,完全没问题。所以这个也不会有问题。

目前,TBtools 有两个工具可以可视化基因结构,其实对应的是 两代绘图引擎,一个是旧版的,JJplot2,一个是新版的,JIGplot。我个人推荐后者。
不过此处先讲以下前者,

JJplot2 对应的工具

使用拟南芥 1000+ 个基因


可以看到,显示出来,都是黑线,跟上述的那个用户结果一样


注意到下方有个摁钮【用GUI工具,要自己机灵一点,参数基本都在摁钮等等】

这不就搞定了吗?

JIGplot 的情况


默认情况下,结果 类似,毕竟是1000个基因。
注意到右侧有Height,修改这个指标,重新可视化


这不就搞定了吗?

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