有时候我不一定能及时回复，但没回复的消息我一般会置顶聊天记录，闲下来会一一回复。
最近有多个朋友问我这个问题：
其实有个问题我一直不太明白，linux是一个系统，python是一种语言，生信是在linux里使用python这种语言吗？
链接里的linux命令，和python有关系吗？画图可以用R，或一些其它的包，python在生信里是用来做什么的呢？
linux，和windows一样，是一个操作系统，但linux不像windows可以用鼠标点击，linux是通过命令行来操作文件的，那对文件的操作就需要用到命令，而我这篇文件就是介绍linux常用的命令，在做生信分析过程中，一般都会用到服务器，服务器都是linux操作系统，所以学习linux常用命令算是学习生信的基础吧。
而R，python，perl，像我们大学学的C,C++,VB，java一样，都是计算机语言。每个计算机语言都有自己的特点，做生信比较早的朋友用的计算机语言基本都是perl（像我），因为它可以很容易处理文本（做生信处理文本比较多），做生信不仅要处理文本，也需要画图和做统计分析，那就需要学习R语言了。但最近几年随着python的兴起和发展，他几乎整合了perl和R的优点，即可以处理文本，又可以画图，所以做生信的研究人员用python的越来越多，而且python学起来特别快，语法比较简单，所以近些年不仅仅是做生信的研究人员，几乎各行各业做各种数据分析基本都需要学习python，最近不是潘石屹都开始学习python了吗。
linux，R,Perl，python了解了吗？欢迎留言交流。
