【r<-开发】Bioconductor包开发（一）：开发环境准备

选择R版本

当Bioconductor devel（开发）分支成为Bioconductor release（发布）分支时，包作者应针对用户可用的R版本进行开发。

R每年（通常是4月中旬）在x.y.z版本号中发布'.y'版本，但Bioconductor每6个月（4月中旬和10月中旬）发布一个.y版本（当前devel发布）。

因为Bioconductor是基于R的生信框架，所以Bioconductor包的开发对当前的R版本有限定：

从4月中旬到10月中旬使用当前的R发布版本
从10月中旬到4月中旬使用R开发版本

4月中旬到10月中旬

使用下面的命令：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "devel")
BiocManager::valid()              # checks for out of date packages

10月中旬到4月中旬

首先安装开发版本的R：

然后运行下面的命令：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version="devel")
BiocManager::valid()