scRNA-seq数据分析
Seurat包学习笔记
Seurat包学习笔记（一）：Guided Clustering Tutorial
Seurat包学习笔记（二）：Integration and Label Transfer
Seurat包学习笔记（三）：Analysis of spatial datasets
Seurat包学习笔记（四）：Using sctransform in Seurat
Seurat包学习笔记（五）：Using Seurat with multi-modal data
Seurat包学习笔记（六）：scATAC-seq + scRNA-seq integration
Seurat包学习笔记（七）：Stimulated vs Control PBMCs
Seurat包学习笔记（八）：Cell-Cycle Scoring and Regression
Seurat包学习笔记（九）：Differential expression testing
Seurat包学习笔记（十）：New data visualization methods in v3.0
Seurat CheatSheet思维导图
Seurat对象解读思维导图
使用Shiny搭建基于Seurat包的单细胞数据可视化平台
Scater包学习笔记
使用scater包进行单细胞测序分析（一）：数据导入与SCESet对象构建
使用scater包进行单细胞测序分析（二）：数据质量控制
使用scater包进行单细胞测序分析（三）：数据降维与可视化
Monocle2包学习笔记
Monocle2包学习笔记（一）：Getting Started with Monocle
Monocle2包学习笔记（二）：Classifying and Counting Cells
Monocle2包学习笔记（三）：Constructing Single Cell Trajectories
Monocle2包学习笔记（四）：Differential Expression Analysis
Palantir包学习笔记
scATAC-seq数据分析
Signac包学习笔记
使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（二）：Motif analysis with Signac
使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（三）：scATAC-seq data integration
使用Signac包进行单细胞ATAC-seq数据分析（四）：Merging objects
Cicero包学习笔记
使用Cicero包进行单细胞ATAC-seq分析（一）：Cicero introduction and installing
使用Cicero包进行单细胞ATAC-seq分析（二）：Constructing cis-regulatory networks
使用Cicero包进行单细胞ATAC-seq分析（三）：Single-cell accessibility trajectory
