单细胞转录组3大R包系列学习笔记

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Seurat包学习笔记

Seurat包学习笔记（一）：Guided Clustering Tutorial
Seurat包学习笔记（二）：Integration and Label Transfer
Seurat包学习笔记（三）：Analysis of spatial datasets
Seurat包学习笔记（四）：Using sctransform in Seurat
Seurat包学习笔记（五）：Using Seurat with multi-modal data
Seurat包学习笔记（六）：scATAC-seq + scRNA-seq integration
Seurat包学习笔记（七）：Stimulated vs Control PBMCs
Seurat包学习笔记（八）：Cell-Cycle Scoring and Regression
Seurat包学习笔记（九）：Differential expression testing
Seurat包学习笔记（十）：New data visualization methods in v3.0
Seurat CheatSheet思维导图
Seurat对象解读思维导图使用Shiny搭建基于Seurat包的单细胞数据可视化平台

Scater包学习笔记

使用scater包进行单细胞测序分析（一）：数据导入与SCESet对象构建
使用scater包进行单细胞测序分析（二）：数据质量控制
使用scater包进行单细胞测序分析（三）：数据降维与可视化

Monocle2包学习笔记

Monocle2包学习笔记（一）：Getting Started with Monocle
Monocle2包学习笔记（二）：Classifying and Counting Cells
Monocle2包学习笔记（三）：Constructing Single Cell Trajectories
Monocle2包学习笔记（四）：Differential Expression Analysis

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