设计qPCR引物

1.打开Primer3Plus在线网页(https://www.primer3plus.com/)进行设计引物;

2.输入序列(目的基因的CDS的核酸序列);

输入序列

3.进行产物长度、引物大小等的设定(如图所示)

对产物长度(一般为80-150bp)、引物长度、退火温度及GC含量设定

4.点击pick primers后得到结果;

结果展示

5.利用DNAMAN检测引物是否存在发卡结构:打开DNAMAN软件,点击primer-Load primer-From Input,输入Forward引物;点击Primer-Two Primer Complementarity-Second primer From Input,即可查看引物能否形成发卡结构。

检测结果(一般选择少于四个发卡结构的引物)

6。满足条件的即可确定为比较好的qPCR引物,发送至公司邮箱合成即可。

这只是设计qPCR引物的其中一种方法,大家可以选择自己熟悉的方法进行设计。

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