问题描述:
conda 安装CARD数据库注释软件rgi时依赖python3.6,
在安装miniconda时,自带的python版本为python3.7
如何更新到自己想要的python版本呢
解决方法:
直接新建一个python环境
在此环境下安装rgi
代码如下:
# rgi普通安装也是成功的,这里只是记录一下如何更新conda里的python版本
- 创建conda新环境py36
conda create -n py36 python=3.6 anaconda
- 启动新环境
cd ~/miniconda/bin
. ./activate py36
- 查找RGI 安装包,显示可用的版本
conda search --channel bioconda rgi
- 创建conda新环境rgi
conda create --name rgi --channel bioconda --channel conda-forge rgi
- 安装rgi
conda install --channel bioconda --channel conda-forge rgi