学习小组Day3笔记--小艳子

linux下的软件安装.png

准备工作

  • 检查有没有bzip2


    image.png

    这样显示就表示有，如果没有的话会报错。

  • 下载miniconda

  1. 百度/谷歌搜索“miniconda”（是英文网站）=》你会看到linux下面有64-bit、32-bit两种版本=〉接下来，查看自己服务器是多少位的=》安装python3.6对应的版本=〉右键-复制下载链接

  2. 根据自己服务器选择64-bit版本

  3. 安装python 3.7对应的Linux下的版本

  4. 右键，复制快捷方式：https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

  5. 登录服务器，输入wget+上面的网址


    image.png

  6. 等待下载完成

  • 安装miniconda

输入代码：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh


image.png

看到这里输入yes


image.png

这样表示安装成功：

image.png
  1. 激活conda
    source ~/.bashrc

使用conda（以fastq为例）

  • 查看当前所有软件列表： conda list


    图片来源于生信星球.png

  • 搜索软件 conda search fastqc


    图片来源于生信星球.png

  • 安装软件 conda install fastqc -y


    图片来源于生信星球

  • 卸载软件 conda remove fastqc -y


    图片来源于生信星球.png

学习收获

慢慢的干货，对于初学者很友好，每天的内容不多但很实用，对于一个研究生很友好了，因为每天都挺忙的，没法抽出太多的时间去干别的事情，学习小组的内容就刚刚好，不会有太大压力，所以虽然这两天特别忙，但还是会抽出时间跟着学一遍，感谢！

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