（1）正常菌群=内源性感染？
从感染角度出发，引起感染的微生物来源分为内源性和外源性，院内感染以内源性为主，这个内源性指的就是人体定植的正常菌群。人体正常菌群是一个非常庞大的微生物群，包括各种细菌、支原体、衣原体、螺旋体、真菌等等，这些都能引起内源性感染吗？我相信，绝大多数是可以的。但其中有些微生物作为成员之一，它们的感染主要是外源性引起，比如曲霉、肺炎支原体和肺炎衣原体。同样作为正常菌群之一，有些可造成感染，有些则需要外源导入呢，白念是内源性感染为主，曲霉则是以外源性感染为主，两者都是正常菌群的一部分？
个人理解，感染意味着菌量较前增加，有些正常菌群比如消化链球菌、消化球菌、肠杆菌科这些能造成感染说明原先占有一定丰度且代时较短，有些正常菌群原先丰度很低且代时较长，感染的菌量需要从外界一次性或连续多次摄入较大剂量，比如支原体。
（二）外源性感染=感染防控？
是不是所有的外源性感染，都需要隔离都需要防控呢？临床上常见的呼吸道传染病，这些毫无疑问是要进行隔离防控的。但比如真菌感染，隐球菌、曲霉以及地方性真菌病引起的外源性感染需要隔离防控吗，其实并不需要。这些绝大多数真菌复制较慢，排外的载量也低，而且空气中真菌孢子本身就较多，而且人群感染这些真菌的阈剂量都蛮高，因此人传人缺少流行病学证据。
（三）内源性感染不需要感染防控？
从感染角度出发，即然是内源性感染，那么隔离是没有意义的。绝大多数院内感染都是内源性为主，但是个别时候也是需要的，特别是耐药问题。
（四）感染防控评估
（1）传染性
评估疾病的传染性，即风险发生的大小。
首先，评估源患者的感染情况，结合微生物、免疫进程、治疗措施综合判断，重点是微生物。不同微生物（病毒、细菌、真菌）的复制能力不一样。生物复制能力越强时间越短，排出体外的载量就越大，一般而言，复制能力 病毒>细菌>真菌，不同病毒不同真菌差异很大。比如说朊毒体，复制周期超长，潜伏期可达十几年；新冠病毒复制很快，在出现症状1—2天前就可以排出病毒造成传染。念珠菌属2-3天即可形成菌落，但隐球菌、肺孢子菌、粗球孢子菌、芽生菌等复制就很慢。其中微生物的变异性会影响到复制，比如新冠病毒的变异，后续毒株的出现使其与受体更易结合，传染性增强。
其次，微生物的抵抗力。排出体外的微生物在外界的抵抗力很大程度影响了载量和活性。一般而言，对外界的抵抗力，亲水病毒>真菌>细菌>亲脂病毒。同样是呼吸道的亲脂病毒对外界的抵抗力不一样，会造成流行曲线的不同。比如说，新冠抵抗力就高于流感。新冠可耐受胃酸、胆汁乳化造成胃肠道的感染，但流感不行。
再其次，跟传播途径相关。呼吸道传染效率高于其他。
最后，跟感染阈剂量有关。感染阈值越低，传染性越高。阈剂量跟微生物和机体免疫相关。不同的微生物复制能力不一样，复制能力越强相对应的阈剂量就越低。从固有免疫角度出发，抗病毒免疫主要靠机体分泌的干扰素，中性和巨噬无法直接进行杀灭；抗细菌免疫的话，首先是补体、其次是中性、巨噬；抗真菌，雷同细菌。因此，综合分析，感染阈剂量，一般是病毒<细菌<真菌，传染性 病毒>细菌>真菌。
（2）疾病的严重程度
有时候评估风险发生的大小也就是传染性，并不好评价，通常都是拿流行病学来进行支持分析。这个时候，综合评估疾病的严重后果可否承担。感染性疾病，其致病作用包括微生物对宿主的直接损伤，细菌的侵袭力、内外毒素、真菌毒素、病毒的杀细胞效应、稳定状态的感染、对宿主DNA整合等等，以及机体在免疫过程中产生的病理损伤（超敏反应1234）。
（3）治疗措施
当感染风险发生以后，有无有效的治疗措施关系到风险应对。在进行抗病毒、抗细菌、抗真菌的用药过程中，有效的抗病毒药物相比抗细菌和真菌而言是很少的。很多抗病毒只能靠机体自身免疫清除，没有有效的靶向药物。
不管是传染性的判别、疾病的严重程度和治疗都离不开对微生物的认识。
