ParaAT2.0 下载和安装
接触Linux第一天，短期目标是Ka/Ks计算
参考好几位网友大神的帖子开始linux系统中Ka/Ks的计算
首先用wget 下载 Para2.0的包 ParaAT - Tools - BIG Data Center - National Genomics Data Center (CNCB - NGDC)
wget ftp://download.big.ac.cn/bigd/tools/ParaAT2.0.tar.gz
参考网友的解压安装包步骤
tar-xf ParaAT2.0.tar
被command not found折磨了很久，又去查了一下，卡在环境变量配置
最后终于搞明白
export PATH=/usr/local/bin/ParaAT2.0:$PATH
cd /usr/local/bin/ParaAT2.0
用winscp把序列信息传到para2.0子目录，输入之后的代码终于不是说找不到command
ParaAT.pl -h homolog_names.txt -n CDS -a Protein.fasta -p proc -o output -f axt
只是提示没有安装比对工具，今天太晚，明天继续
Checking multiple sequence aligner: clustalw2[NA] t_coffee[NA] mafft[NA] muscle[NA]
