plink 用法

最近在学习plink软件的用法:
用到什么就查一些东西,零零碎碎,整理一下,当做备份。

plink --file data --recodeAD --recode-allele recode.txt

如果想将基因型转化为0,1,2
可以使用命令:plink --bfile file --recodeA --out recodefile

如果想将基因型转化为0,1
可以使用命令:plink --bfile file --recodeD --out recodefile

如果想将基因型同时转化为0,1和0,1,2
可以使用命令:plink --bfile file --recodeAD --out recodefile

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