引用赵立平教授的工作《A core microbiome signature as an indicator of health》，链接：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)01038-9
赵老师的观点是在做宏基因组分析时采用数据库比对的方式往往会过滤一些未分类的读段，本着基因在基因组上的原则，将这些未分类读段组装为基因组视为一个微生物菌。然后通过共网络的方法划分功能群，每一个功能群可能有不同科，属的菌（也有一些未知的菌），但是他们的功能近似，通过这个方法可以鉴定新的，具有某种功能的菌
如下图，区分的是功能群微生物，他们在不同处理组丰度中往往同升或同降，同功能群内正相关，不同功能群内负相关
