学习小组Day6--孙大雅

对待R要高冷,拒绝可以拒绝的一切

1.高级的镜像设置

不想每次打开Rstudio都要运行一遍镜像配置,就需要用到R的配置文件.Rprofile

  • 首先用file.edit()来编辑文件:
    file.edit('~/.Rprofile')
  • 然后在其中添加好options代码
# options函数就是设置R运行过程中的一些选项设置
options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) #对应清华源
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") #对应中科大源
# 当然可以换成其他地区的镜像
  • 最后保存然后重启Rstudio
    再运行一下:
    options()$repos
    options()$BioC_mirror
    发现已经配置好了,省了手动运行的步骤

2.R包安装

  • 第一种:CRAN网站
    install.packages(“”)
  • 第二种:Bioconductor网站
    BiocManager::install(“”)

3.R包加载

  • 两者均可
    library()
    require()

(总结)4.安装加载三部曲:("dplyr")为例

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) 
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") 
install.packages("dplyr")
library(dplyr)

5.dplyr五个基础函数

(示例数据:test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),])

(1)新增列

mutate(变量,新增列名=新增内容)

(2)筛选列

select(变量,筛选条件)

(3)筛选行

filter(变量,筛选条件)

(4)排序

  • 按某1列或某几列对整个表格进行排序
    arrange(变量,筛选条件)

(5)汇总

summarise(变量,筛选条件)

  • 结合group_by,根据分组再汇总分析


6.dplyr两个实用技能

(1)管道操作

  • %>% :向右操作符
    把左侧准备的数据或表达式,传递给右侧的函数调用或表达式进行运行,可以连续操作就像一个链条一样
    %>%
    (cmd/ctr + shift + M)
    -所以上述的一串代码可以变成简单的一串

(2)统计某列的unique值:count

count(变量,筛选条件)

7.dplyr处理关系数据

注意:2个表进行连接,不要引入factor
载入数据:

88.pn

(1)內连,取交集

inner_join

(2)左连

left_join

(3)全连接

full_join

(4)半连接

  • 返回能够与y表匹配的x表所有记录
    semi_join

(5)反连接

  • 返回无法与y表匹配的x表的所记录
    anti_join

(6)简单合并

  • 相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数
  • bind_rows()
    需要两个表格列数相同
  • bind_cols()
    需要两个数据框有相同的行数

下面进行操作:
先准备数据


再操作:



最后的最后:
今日的思维导图:


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