现有的检测Crisp编辑结果的软件清单

二代测序分析Crisp的软件列表

检测工具 工具的特点 工具的论文期刊年份
Hi-TOM2 在线网站,输入的文件大小有限制 SCIENCE CHINA Life Sciences 2024
CRISPResso2 linux下conda或docker安装 Nature biotechnology 2019
CRISPR-GRANT 全平台软件 win/mac/linux BMC Bioinformatics 2023
CrisprStitch 全平台win/mac/linux Plant Communications 2023

一代测序分析Crisp编辑信息的软件列表

工具名称 在线地址 离线应用地址
TIDER https://apps.datacurators.nl/tider -
ICE https://ice.editco.bio/ https://github.com/synthego-open/ice
SuperDecode http://www.crispr-ge.com/superdecode/ https://github.com/xiexr/SuperDecode

SuperDecode支持一二三代测序数据的分析。

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