机器学习 - DBSCAN聚类算法

1. DBSCAN简介

  • 密度聚类 (亦称基于密度的聚类算法,density-based clustering)算法假设聚类结构能通过样本分布的紧密程度确定。通常情况下,密度聚类算法从样本的密度的角度来考察样本之间的可连接性,并基于可连接性不断扩展聚类簇已获得最终的聚类结果。
  • DBSCAN是一种著名的密度聚类算法,它基于一组“领域”参数(\epsilon, MinPts)来刻画样本分布的紧密程度。 和K-Means,BIRCH这些一般只适用于凸样本集的聚类相比,DBSCAN既可以适用于凸样本集,也可以适用于非凸样本集。
  • 凸样本集定义: 简单来说,数据集D中任意两点的连线上的点,也会在数据集D内,那么数据集D就是一个凸集。如下图所示就是一个非凸样本集,Kmeans效果表现非常差。
Kmeans聚类和DBSCAN聚类效果对比.png

2. DBSCAN基本概念

对于给定的数据集D = (x_1, x_2, ..., x_m),定义以下几个基本概念:

  • \epsilon-领域:x_j \in D, 其\epsilon-领域包含样本集D中与x_j的距离不大于\epsilon的样本,即N_{\epsilon}(x_j) = \{x_i \in D | dist(x_i,x_j) \leq \epsilon \}
  • 核心对象(core object):x_j\epsilon-领域至少包含MinPts个样本,即|N_{\epsilon}(x_j)| \geq MinPts,则x_j是一个核心对象;
  • 密度直达(directly density-reachable):x_j位于x_i\epsilon-领域中,且x_i是核心对象,则称x_jx_i密度直达;
  • 密度可达(density-reachable):x_ix_j,若存在样本序列p_1, p2, ..., p_n其中p_1 = x_i, p_n = x_jp_{i+1}p_i密度直达,则称x_jx_i密度可达;
  • 密度相连(density-connected):x_ix_j,若存在x_k使得x_ix_j均由x_k密度可达,则称x_ix_j密度相连;
  • 下图中蓝色点为核心对象,假设MinPts=3


    DBSCAN基本概念举例.png

3. DBSCAN核心思想

  • DBSCAN将“簇”定义为:由密度可达关系导出的最大的密度相连样本集合。DBSCAN算法首先任选数据集中的一个核心对象为“种子”,再由此出发确定相应的聚类簇。首先根据领域参数(\epsilon,MinPts)找出所有核心对象,然后以任意核心对象为出发点,找出由其密度可达的样本生成聚类簇,直到所有核心对象均被访问过为止。
DBSCAN算法流程.png
  • 首先找到所有的核心对象(Core Point)集合,下图的红色点为核心对象;
核心对象举例.png

所有的核心对象.png

所有的非核心对象.png
  • 其次,随机挑选一个核心对象,以此对象出发由密度可达关系导出最大的密度相连样本集合。
随机选择一个核心对象.png

找到密度相连样本集合.png

非核心对象处理.png

离群点.png

特殊case的处理.png

4. sklearn中使用DBSCAN聚类算法

参考文档:https://scikit-learn.org/stable/modules/generated/sklearn.cluster.DBSCAN.html

sklean dbscan算法.png

参考资料

刘建平Pinard博客

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