宫颈癌目前是中国女性第二大常见恶性肿瘤,也是女性癌症死亡的第四大原因。南方医科大学深圳医院病毒肿瘤学深圳市重点实验室郭霞团队在《Advanced Science》上发表了题为“NAT10/ac4C/FOXP1 Promotes Malignant Progression and Facilitates Immunosuppression by Reprogramming Glycolytic Metabolism in Cervical Cancer”的研究论文,使用海星生物(HySigen)提供的Cas9基因编辑系统及相关载体开展了一系列实验,助力宫颈癌的研究。研究发现,宫颈癌(CCa)组织中 NAT10 的表达显著升高,且这种高表达与患者预后不良在临床上相关。进一步研究表明,HOXC8 通过结合 NAT10 启动子激活 NAT10,进而促进 FOXP1 mRNA 的 ac4C 修饰并提高其翻译效率,最终诱导 GLUT4 和 KHK 的表达。此外,NAT10/ac4C/FOXP1 轴的活性导致了宫颈癌细胞糖酵解增强及乳酸分泌持续增加。值得注意的是,敲低 NAT10 增强了体内 PD-L1 阻断介导的肿瘤消退疗效。综上所述,这些发现揭示了 NAT10 在启动癌细胞糖酵解与免疫抑制之间交互作用方面的致癌作用,提示其可作为宫颈癌联合 PD-1/PD-L1 阻断免疫治疗的潜在靶点。

一、研究方法
1. NAT10 在宫颈癌中发挥潜在的致癌作用
结果显示,与NAT10低表达的宫颈癌组织相比,NAT10高表达的宫颈癌组织中TP53、UBR4、KRAS和FBN1等关键基因的突变率显著更高(图1e)。ESTIMATE分析进一步表明,在宫颈癌中,NAT10的高表达与较低的ESTIMATE评分及基质评分(stromal score)相关,这揭示了NAT10在调节宫颈癌肿瘤免疫中的关键作用(图1f–h)。

2. 转录因子 HOXC8 激活宫颈癌中 NAT10 的转录
为了明确该关键转录因子(TF)对 NAT10 转录的影响,研究人员进行了双荧光素酶报告基因检测。结果显示,HOXC8 与 NAT10 启动子质粒共转染显著提高了荧光素酶活性(以萤火虫荧光素酶/海肾荧光素酶的比值衡量);相比之下,仅转染载体对照质粒或单独转染 NAT10 启动子质粒时,两种宫颈癌细胞系中的该比值均较低(图 2m)。与上述结果一致,Western blot 检测显示,在 宫颈癌细胞中导入靶向 HOXC8 的特异性 siRNA 后,NAT10 的表达受到显著抑制(图 2n)。综上所述,这些数据有力地表明,HOXC8 可能通过结合 NAT10 启动子区域并促进其转录,从而上调宫颈癌细胞中 NAT10 的表达(图2o)。

3. NAT10 敲低在体内外抑制宫颈癌细胞的增殖、侵袭和转移
为了进一步明确 NAT10 诱导的宫颈癌细胞体外增殖能力是否赋予了其体内成瘤能力,我们利用经萤火虫荧光素酶(-luc)标记且 NAT10 表达被稳定沉默的 SiHa 细胞(NAT10+/- SiHa),构建了裸鼠皮下异种移植模型。结果显示,NAT10 的下调显著抑制了接种 SiHa 或 NAT10+/- SiHa 细胞的小鼠体内的肿瘤生长(图 3g)。在体内实验结束时切除肿瘤,观察到 NAT10 敲低组宫颈癌 肿瘤的生长速率降低(图 3h)。此外,活体动物成像检测到的荧光素酶信号强度每周显著增强,证实了肿瘤在持续生长(图 3i,j)。这些结果证实,NAT10 发挥促癌作用,并能促进宫颈癌细胞的增殖、侵袭和转移。

4. NAT10/ac4C/FOXP1轴通过靶向GLUT4和KHK增强糖酵解
有趣的是,CUT&Tag 测序数据显示 FOXP1 在 GLUT4 和 KHK 的启动子区域显著富集(图4f);既往大量文献已证实,这两个基因均参与糖酵解过程。ChIP-qPCR 结果进一步表明,在敲低 FOXP1 后,FOXP1 信号在 GLUT4 启动子区域的富集程度大幅降低(图 4g)。此外,基于通过 GEPIA 对 TCGA 数据集的分析,在宫颈癌中,GLUT4 的表达与 FOXP1 及 NAT10 的表达呈正相关,而 KHK 的表达也与 NAT10 的表达呈正相关(图 6h,i;图 S2d,支持信息)。进一步研究发现,敲低 NAT10 或 FOXP1 均会导致 GLUT4 和 KHK 在转录和翻译水平上的表达受到抑制,这一结果已通过 qRT-PCR(图 4j–m)和 Western blotting(图 4n)得到证实,提示 FOXP1 调控着 GLUT4 和 KHK 的表达。

5.NAT10/ac4C/FOXP1 轴活性增加高糖酵解肿瘤中的 Treg 浸润
鉴于NAT10/ac4C/FOXP1 轴在促进免疫检查点基因上调及随后的免疫逃逸中发挥作用,抑制该轴可诱导 PD-L1 阻断介导的肿瘤消退,进而抑制宫颈癌的进展。联合治疗显示出远优于单药治疗的疗效。
针对FOXP1 与肿瘤浸润免疫细胞(TIICs)的差异表达及相关性分析结果显示,FOXP1 的过表达与调节性 T 细胞(Tregs)及活化 CD4+ T 细胞的浸润呈正相关,而与 M1 型巨噬细胞、静息 NK 细胞及静息 CD4+ 记忆 T 细胞的浸润呈负相关(图 5j)。
值得注意的是,已有研究证实Tregs 可摄取肿瘤微环境(TME)中的乳酸,以维持其在体内的存活与分化。考虑到代谢失调与免疫细胞浸润之间的相互作用,我们通过免疫组化技术检测并验证了不同组别中 PD-L1 的表达情况;结果显示,在 U14-oeFOXP1 组中,TME 内的 PD-L1 表达呈上升趋势(图 5n)。综上所述,我们的研究揭示了宫颈癌中肿瘤代谢与免疫应答之间的相互作用。具体而言,靶向宫颈癌肿瘤中的 NAT10/FOXP1 轴,不仅能抑制肿瘤细胞的糖酵解,还能减少 Treg 群体向 TME 的浸润,从而协同增强 PD-L1 阻断疗法的疗效,最终抑制肿瘤进展。

二、研究结论
文章利用结合acRIP-seq、Ribo-seq 和 RNA-seq 数据的多组学筛选策略,旨在阐明 NAT10 在宫颈癌中的作用机制,并发现 FOXP1 是 NAT10 介导的 ac4C 修饰的关键下游靶点。
然而,NAT10 在肿瘤进展和免疫抑制中的具体功能及机制尚不明确。本研究揭示了 NAT10 介导的 ac4C 修饰能上调宫颈癌细胞中 FOXP1 的表达,进而引起 GLUT4 和 KHK 的转录上调,最终导致糖酵解增强。由此产生的乳酸在肿瘤微环境(TME)中的积累进一步促进了调节性 T 细胞(Treg)的浸润。值得注意的是,在体内实验中,敲低 NAT10 与 PD-L1 阻断疗法具有协同作用;通过抑制肿瘤细胞糖酵解、减少乳酸生成、减轻免疫抑制并增强免疫监视,从而促使肿瘤消退。
FOXP3 作为 Treg 发育和功能的特异性标志物,参与免疫系统的调节。鉴于 FOXP 家族蛋白在功能上具有相似性,且存在与 TME 组分(如炎性细胞因子)密切相关的蛋白质-蛋白质相互作用,研究证实 FOXP1 通过促进 FOXP3 介导的基因表达调控,在 Treg 中发挥着不可或缺的作用。本研究的一个重要发现是:PD-1 阻断与乳酸抑制产生协同效应,增强了 Treg 的抑制功能并阻碍了抗肿瘤免疫。本研究揭示了 NAT10 介导的 FOXP1 过表达诱导宫颈癌细胞糖酵解增强并促进 Treg 浸润 TME,进而导致宫颈癌免疫逃逸的机制,同时也为开发 NAT10 抑制剂作为新型治疗药物奠定了坚实基础。
文章提供了强有力的体内外证据,揭示了 NAT10 在宫颈癌进展中发挥致癌作用;研究证实,作为关键的表观转录组调控因子,NAT10 介导的肿瘤细胞 ac4C 修饰可上调转录因子 FOXP1,进而通过重编程糖酵解代谢,增加调节性 T 细胞(Treg)浸润并促进宫颈癌的免疫抑制状态。此外,敲低 NAT10 可通过抑制肿瘤细胞糖酵解、减少乳酸生成及增强肿瘤微环境(TME)内的免疫监视,显著提高 PD-L1 阻断疗法的疗效,最终实现肿瘤消退。这项关于NAT10 介导 ac4C 修饰机制的研究,有望为宫颈癌的深入探索提供重要依据,并推动具有前景的治疗策略的开发。
本研究中 NAT10 杂合敲除 SiHa 细胞株、靶向干扰载体等核心实验材料均由海星生物 Cas9 基因编辑体系构建完成,可靠的基因修饰工具保障了 ac4C 修饰、糖酵解调控、体内肿瘤免疫功能表型实验可重复。海星生物 Cas9X®全流程 CRISPR 技术平台,具备标准化 sgRNA 设计算法、低内毒级载体构建、多种病毒规模化包装、单克隆细胞纯化鉴定完整能力,支持常规肿瘤细胞、原代免疫细胞、干细胞的基因编辑;其 CRISPRSeek™文库筛选系统可实现通路 / 全基因组高通量靶点挖掘,配套 NGS 测序、多组学联合数据分析服务。企业通过 ISO9001 质量管理体系与 P2 实验室资质,所有实验服务经过多重质控,有效降低脱靶风险、提升实验稳定性,广泛服务于表观转录组、肿瘤代谢、肿瘤免疫等前沿基础医学方向,持续为国内科研团队提供高性价比、高重复性 CRISPR 基因编辑整体解决方案。