aspera下载

单个文件下载:

ascp -i /home/shen/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T -l 100m anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR671/SRR6714645/SRR6714645.sra ./

多个文件下载:

for i in 44 45 48 49

do

ascp -i /home/shen/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T -l 100m anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR671/SRR67146"$i"/SRR6714"$i".sra ./

done

分割SRR文件:

fastq-dump --split-3 *.sra

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容