通过NCBI下载mRNA的序列

最近需要获得一批引物,直接交给公司设计较慢,设计过程中需要获得mRNA的序列,于是稍微学习了一下,现记录一下。

先是登陆NCBI网站主页:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

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Database选择gene

输入自己想想获得的mRNA的基因名,最好加上种属在后面,这样子后续比较方便。


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选择自己需要的基因链接进去,注意再次核查基因的种属。


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滑到下面的mRNA and Protein(s)一项中。点击[NM_001108128.1]进入mRNA的界面中

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其中ORIGIN是mRNA的完整序列,包含内含子之类的,左边的CDS是mRNA的conding sequence,点击后,Origin中的序列中变红的就是CDS。


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在复制的过程中我发现,直接选择复制的话,左边的行名也会复制出来,比较麻烦,后来又发现一个直接导出的功能,见右上角。


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选择coding sequence,点击Create,会直接下载CDS的fasete文件的txt,复制比较方便。


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好了,就这样,以后学习新的东西也会继续上传记录。

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