最近需要获得一批引物,直接交给公司设计较慢,设计过程中需要获得mRNA的序列,于是稍微学习了一下,现记录一下。
先是登陆NCBI网站主页:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Database选择gene
输入自己想想获得的mRNA的基因名,最好加上种属在后面,这样子后续比较方便。
选择自己需要的基因链接进去,注意再次核查基因的种属。
滑到下面的mRNA and Protein(s)一项中。点击[NM_001108128.1]进入mRNA的界面中
其中ORIGIN是mRNA的完整序列,包含内含子之类的,左边的CDS是mRNA的conding sequence,点击后,Origin中的序列中变红的就是CDS。
在复制的过程中我发现,直接选择复制的话,左边的行名也会复制出来,比较麻烦,后来又发现一个直接导出的功能,见右上角。
选择coding sequence,点击Create,会直接下载CDS的fasete文件的txt,复制比较方便。
好了,就这样,以后学习新的东西也会继续上传记录。
886