真是全新的领域，有点激动也有点不知所措，感觉回到了当年对组学一无所知的状态，越来越觉得自己的渺小和浅薄。加油啊，每天都在进步。第一天忘记投稿，而且还没发表成功，real rookie in this field~
一 Linux 和服务器
- Linux是一套免费使用和自由传播的类 Unix 操作系统，是一个基于 POSIX 和 UNIX 的多用户、多任务、支持多线程和多 CPU 的操作系统。
- 服务器是计算机的一种，它比普通计算机运行更快、负载更高、价格更贵。服务器在网络中为其它客户机（如PC机、智能手机、ATM等终端甚至是火车系统等大型设备）提供计算或者应用服务。服务器有阿里云服务器、腾讯云服务器、百度云服务器、华为云等
- 目前国内 Linux 更多的是应用于服务器上，而桌面操作系统更多使用的是 Windows
Note:服务器和电脑是相互独立的。电脑好坏、系统类型并不影响使用服务器。
二 putty
- 远程登录服务器（是一款集成虚拟终端、系统控制台和网络文件传输为一体的自由及开放源代码的程序）
- 目录：是我们平时说的文件夹；路径：就是目录的层级位置。如：home目录下有个biosoft，则biosoft的路径为/home/biosoft
- 官网下载安装成功后，在界面填写远程服务器IP地址，以及ssh连接端口（可在saved sessions输入IP点击save），点击open，login as 输入用户名回车，输入密码回车，登录成功（在首次登录前可能要让你选择是否添加key，yes回车；注意密码输入的时候是看不见密码的，三次机会；否则你需要关闭putty后重新打开putty）
三 putty常用命令
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Snipaste_2019-11-26putty常用命令.png
Snipaste_2019-11-26putty常用命令.png
1 在界面输入pwd
（ print working directory，显示当前路径）
Snipaste_2019-11-26显示路径.png
2 创建空目录
（mkdir(make direction;#后为注释，解释代码的文字，不用输入）
- mkdir biosoft #存放生信软件
- mkdir project #存放生信项目
- mkdir tmp #存放一些杂七杂八
- mkdir src #存放源代码
Snipaste_2019-11-26建空目录.png
Snipaste_2019-11-26建空目录2.png
3 输入：ls显示列表，不管是目录还是文件
Snipaste_2019-11-26_显示列表.png
4 删除：删除的操作对象分为三类：普通文件、空目录、有内容的目录。对应的命令是略有不同的。
NOTE：这三个命令后面都要跟上你要删除的目录名
- 删除文件--rm（即：rm 文件名）
- 删除空目录--rmdir（即：rmdir 空目录名）
- 删除非空目录--rm -r（即：rm -r 非空目录名）
- rm-rf（恐怖命令，rm -rf后面不加目录名，删除你服务器的所有东西，千万千万不要尝试）
-r 递归，多级目录一并删除
-f 强制删除，不用任何提示
Snipaste_2019-11-26删除.png
5 进入目录，查看当前路径，返回主目录
- cd 接一个目录名，进入该目录（cd tmp）
- cd - 返回刚才的目录，如电视遥控器的返回键(cd -)
- 主目录（家目录）：直接cd
Snipaste_2019-11-26_cd进入目录及返回目录.png
6 vi 新建脚本或者文本文档
（vi是linux中的文本编辑器）
- cd tmp#进入tmp目录
- vi hello_world.txt #先保证电脑切换到了英文输入法，然后敲i键，* 就可以输入了
- Esc #退出编辑模式（键盘上esc）
- :x #保存退出
Snipaste_2019-11-26进入目录建立文本编辑.png
7 查看文件
- cat #查看并直接将内容输出到屏幕（先进入目录，然后在该目录下cat +文本名）
- head #默认输出前10行，
-
tail #默认输出后10行，后面加上 -n 自定义输出几行
例如：head -n 3 hello_world.txt 【注意-n与head之间有空格，-n和3之间空格可有可无】
Snipaste_2019-11-26查看文件.png
8 复制文件
cp file1 file2
Snipaste_2019-11-26复制文件.png
9mv 将文件一如文件夹，或者重命名
- mv file1 file2#如file2不存在，则将file1重名为file2，如file2本身存在，则file1存于file2路径下
-
move file1 路径#需在file1路径下进行移动到你想存的路径mv 将文件一如文件夹，或者重命名
Snipaste_2019-11-26_文件重命名和移动.png
技能补充
- 网址：https://man.linuxde.net/
- 哔哩哔哩-马哥Linux视频课程
