【数据库】TISIDB→肿瘤免疫大合集

在做肿瘤免疫相关性分析时,发现一个神奇的网站:TISIDB(an integrated repository portal for tumor-immune system interactions)



据说TISIDB整合了5大数据库,能进行10种分析和注释。


1.TISIDB探索

下面以CD96为例进行探索:



最重要的出场了,一共10种分析结果:


1.1 Immunotherapy

展示CD96基因与免疫治疗反应的关系,在单基因免疫分析中还是非常好用的。

1.2 Lymphocyte

分析28种TILs细胞与目标基因的相关性


1.3 Immunomodulator

免疫调节因子与目标基因相关性:Immunoinhibitor, immunostimulator, MHC molecule.

1.4 Chemokine

细胞因子和受体与目标基因



1.5 subtype

免疫亚型和分子亚型与目标基因


1.6 Clinical

临床特征,如OS, stage,grade与目标基因



可以看出TISIDB对于单基因泛癌免疫相关分析,还是非常友好的,下面就来看一下SCI论文是怎么应用的。

2.实战



参考链接:

A Comprehensive Bioinformatics Analysis of Notch Pathways in Bladder Cancer

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容