今天主要学习以下主要内容：

1. 什么是linux，什么是服务器？
2. 为什么学生信要用linux？
3. 怎样召唤linux--阿里云服务器
4. 怎样登录服务器--xshell和terminal
5. linux有哪些最基本的操作？

生信星球-公众号

生信宝典linux常用命令

• pwd：列出当前目录的完整路径，明确你在哪；
• cd ：跳转到其他目录，两个好用的cd命令，"cd -" 跳回最近一次的目录，"cd .." 退回上一层目录；
• ls：列出当前目录内容，最好加上 -l -rt 参数，会更加清晰，目的是明确目录下都有什么；
• mkdir：创建目录；
• rm：删除文件或者目录；
• mv：重命名文件或者目录；
• cat：打开文本文件，内容输出到屏幕；
  -less -SN：打开文本文件，这个是查看文本文件更合适的方式；
• head -n：查看文件前n行；
• tail -n：查看文件尾n行；
• wc -l：计算文本文件的行数；
• ”|“： 管道操作；
• grep命令；
• awk命令；
• sed命令；
• sort命令；
• du -sh ./: 检查当前目录所占空间大小；
• bc -l：启动Terminal下的计算器，可以在这里进行简单的数学运算，输入"quit"就可以退出；
• chmod：修改文件或者目录权限；

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练习：

linux服务器的练习

学习linux如何安装软件：

1. 了解conda--“linux的应用商店”

2. 服务器下载精华版--miniconda（生信相关）

   • 百度/谷歌搜索“miniconda 清华”进入：
     https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda
   • 用wget命令下载：复制的下载链接

3. 安装和配置miniconda

   • ls命令得到“查询结果”
   • bash “查询结果”
   • 激活：source ~/.bashrc
   • 添加镜像：

- conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
- conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
- conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
- conda config --set show_channel_urls yes

4. 使用miniconda下载和卸载软件

备注：学习自动补全功能：打出cd+tab键，好用

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