Conda

conda相当于linux的应用商店，是最方便快捷的软件下载器。
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 安装Miniconda。
source ~/.bashrc 激活。

添加镜像

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

conda list 查看conda的软件列表
conda search　软件名称 搜索软件。
conda install fastqc -y　安装软件fastqc。-y is yes.
conda remove fastqc -y 缷载软件。

conda info --envs　查看当前的conda环境。
#　 conda environments:
#　base * /home/bio05/miniconda3 #前面带*的就是默认的。
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y 建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic（这两个可以一步完成）(这里指定python版本是因为有的软件是基于python开发的，不是要你学python或者用它干什么。)
conda activate rna-seq 激活新的conda环境。
conda deactivate 退出当前环境。