MES系统的核心思想是在统一的技术平台上，通过标准化的数据和业务操作流程，全面、及时和集成地体现企业日常经营业务中“物流”、“资金流”和“信息流”，从而实现三流合一。 MES管理系统 是企业管理层次的信息系统，不同于企业控制和生产层次上的信息系统(例如DCS系统)，更不是日常办公系统(例如微软OFFICE或电子邮件系统);系统建立在企业内部网络的基础上，通过畅通的内部网络将企业各单位有机地连接起来。
MES系统在实施中结合优秀“管理思想”的必要性
真正要让MES应用产生比较好的效益，除了利用MES的技术外，还需要引入先进的管理理论、思想和方法，将先进的管理思想与管理技术结合起来，才能最有效提升企业的管理水平。当然这对咨询顾问提出了更高的要求，MES实施顾问不仅是技术人员，更是管理人员。即MES实施人员不能仅仅对系统比较了解，更需要对企业的业务了解，还要熟悉该业务操作下可适用的优秀管理方法，并将优秀的管理方法灵活运用到企业中去，提升企业的管理水平，谋求效益的提升。因而MES项目不仅是技术项目，更是管理项目。所以企业在实施MES的过程中，需要相应的管理变革，即需要做一些流程优化、组织机构和管理制度及管理方法的变革工作。只有结合了管理方法变革工作的MES实施与应用，才能最大效度地为企业创造效益。
“MES系统管理思想(方法)”变革的意义
企业生产的四个主要要素：人、物(材料)、设备和方法。假设投入同样的人、物、设备，而采用不同的方法进行生产操作与管理，产出的效益是不一样的。先进的方法带来的效益可以是不增加成本的产出。所以，企业管理者总想到行业标竿企业中去参观、去学习方法，以提升和改进自身的方法。这里的方法包含运行体系、标准操作、工作方法、管理图、检查表等内容，但参观所看到的东西是有限的，只看到表象，而不了解具体的细节。纯粹靠自己摸索来提升和改进方法的道路是曲折的，会走很多弯路，并要付出更多的代价。
从管理本身来看，管理可分为三个层面。一个层面是管理理论，另一个层面是管理实践，还有一个层面就是介于上述两者之间的管理技术和方法，此层面把最新的和适用的管理理论转变成可操作、可执行的管理实践，把世界上先进、实用和成熟的管理理论迅速介绍和运用于所需的企业，以提高他们的市场竞争力，这个层面的推动者就是管理咨询公司。管理咨询缩短了理论运用于实践的时间，对企业的发展和企业竞争力的提高有着不可替代的作用。对企业领导和管理人员来说，管理咨询公司的支持，能帮他们在管理中少走弯路，用更系统的管理方法引领企业发展，跳出经验思维的圈子来看问题。
聘请资深管理咨询顾问与公司各部门人员一起来改善管理方法，是最有效的管理变革之道。作为资深顾问一般都有10个项目以上的经验，他们对不同企业的业务管理方法有较深入的研究和了解。如果在 MES系统 实施时，把行业中比较先进的管理理论和方法应用到企业中，结合MES的先进技术，企业的管理水平就一定会得到很大的提高。
