2024年单细胞空间系列课程

作者，Evil Genius

又到了大家比较痛苦的时候了~~~~

日前需要开展单细胞空间的系列课程了，课表如下:

第一课:单细胞联合突变信息分析

第二课:单细胞数据分析之新版 velocity

第三课:单细胞数据分析之 CNV 聚类

第四课:单细胞通讯分析大汇总(cellphoneDB、NicheNet、CellChat)

第五课:单细胞联合 VDJ分析

第六课:单细胞联合 ATAC 分析

第七课:空间转录组整合分析与形态学判定(空间注释)

第八课:单细胞空间联合分析(cell2location)与区域细胞富集

第九课:空间细胞类型共定位与细胞通路同定位

第10课:单细胞空间联合分析之 MIA

第 11 课:空间生态位通讯与 COMMOT

第 12 课:空间转录组之分子 niche 与细胞 niche

第 13 课:空间网络(基因、细胞、通路网络)

第14课:空间转录组微生物的检测运用

第 15 课:空间 VDJ(暂定)

第 16 课:空间 CNV burden 与 CNV 聚类

第 17 课:空间邻域分析(banksy、CellNeighborEx)，分子邻域与细胞邻域

第 18 课:空间转录组 hotspot

第 19 课:空间细胞“社区”(空间细胞“unit”)

第20课:空间基因梯度

第21课:空间转录组的活性空间域

第 22 课:空间转录组之 velocity

第 23 课:空间轨迹

第24课:细胞邻域特征评分(异型细胞网络)

第25课:空间分子生态位差异分析

第 26 课:高精度 HD 平台数据分析框架

第 27 课:高精度 HD 平台分析内容与 niche

第 28 课:Xenium 分析框架

第29 课:原位数据细胞分割导论

第 30 课:Xenium 生态位分析与微环境分析

大致课程如上，可能有一到两节课的波动，单细胞的基础分析不包含在内(教程很多了，大家自己翻一翻就可以)，空间的基础分析去年讲过的，没有更新的就不多讲了，有更新的我们补充一下，费用的话，定为4000，且本篇内容也是付费，需要200，可以加上我的微信，报账的话，我也联系了，试剂费、会议费均可，但是如果上课需要先把钱交给我这个坏人，账报下来会返还给大家。大家量力而行，如果因为个人原因无法上课，钱全部返还，但是如果大家付了200不上课的话，这200就浪费了，我会拉个上课群，大家一定要量力而行

初步计划22号开始上我们的第一节课。

本文定时发布在凌晨12点，这时候大部分人都睡了，我也睡了，原则上就是小范围授课，一定要低调，大家加我我看到了就会通过。

生活很好，有你更好

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