## 安装和准备
IGV是一款功能强大的基因组浏览器,可以可视化多种基因组数据,包括基因结构。首先需要从官方网站(https://software.broadinstitute.org/software/igv/)下载并安装适合您操作系统的版本。安装完成后,打开IGV并加载参考基因组序列(可以是本地的基因组文件或者从IGV服务器加载预构建的基因组)。
## 导入GTF文件
在IGV界面中,通过“File” - > “Load from File”选项选择您的GTF文件。IGV会根据GTF文件中的信息在基因组坐标上绘制基因结构,包括外显子、内含子等区域,并且可以根据链的方向正确显示基因的方向。您可以通过缩放和平移功能查看基因的详细结构和在染色体上的位置关系。
查看结束后,可以通过“File“->”Save Session”保存会话文件,便于后续查看。
https://gitee.com/biox-lab/biclass.biox/blob/master/%E4%BF%AE%E4%B8%9A/Biology/Systems-Biology/OMICS/Genome/Visualization/IGV/%E4%BD%BF%E7%94%A8IGV%E7%BB%98%E5%88%B6%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%93%E6%9E%84.md
#Genome #IGV