寻阳叛乱被平定后，效忠寻阳政权的徐州刺史薛安都、益州刺史萧惠开、梁州刺史柳元怙、兖州刺史毕众敬、豫章太守殷孚、汝南太守常珍奇都派使节请求投降。
宋明帝认为西南的叛军已经平定，打算向淮河以北的这些叛军炫耀威力，下诏命张永、沈攸之等人率大军五万人北上迎接薛安都。
尚书左仆射蔡兴宗劝谏说：“薛安都归顺朝廷，绝对不会有假，现在需要派一个人，手拿一封信前去迎接。如果用重兵迎接他，他一定会惊疑忧虑，甚至可能招引北方的胡虏，灾患势必更深。如果说他身为叛逆，罪恶深重，非诛杀不可，那么从前所赦免的人可太多了。何况薛安都在外，据守的是北战场的一个大重镇，紧接边界、地势险要、兵力强大，无论包围还是攻击，都难以攻克。为了国家的利益，尤其应该使用和平的手段安抚。一旦他叛投魏国，那么朝廷就要昼夜辛劳去对付后患了。”
明帝正陶醉在打了胜仗的美好感觉中，不肯接受他的意见，又对萧道成说：“我正想利用薛安都反抗的机会对他加以讨伐，你认为如何？”
萧道成回答说：“薛安都十分狡猾，今天如果用大军逼他，恐怕对朝廷没有好处。”
明帝不以为然地说：“我们各路人马都很精锐，哪次出击不能战胜，你不要多说了！”
薛安都听到大军北上的消息，果然非常恐惧，派遣使节向北魏投降，常珍奇也向北魏投降，献出郡城悬瓠，二人同时请北魏发兵救援。
北魏自从文成帝拓跋浚即位后，使老百姓休养生息、安心种植，实行怀柔政策，安抚远近民众，民心得以慢慢安定下来。
时间不长，在公元465年，年仅二十六岁的拓跋浚在太华殿去世，由太子拓跋弘继承帝位，是为献文帝，下令大赦天下，尊皇后冯氏为皇太后。
献文帝拓跋弘这年才十二岁，所以朝政大全都掌握在车骑大将军乙浑手里。乙浑假传圣旨，杀害了尚书杨保年、平阳公贾爱仁、南阳公张天度等人。
此时，北魏平原王陆丽正因病在代郡温泉治疗，乙浑派穆多侯去征召他回京。穆多侯对陆丽说：“乙浑已有反叛的心意，如今，先帝刚刚晏驾，大王您又是素来德高望重的，被奸佞贼臣所忌恨，所以，您还是暂时留在这里，听听动静再说，待朝廷安静下来再回去也不迟啊！”
陆丽说：“哪里有听说君父死了，忧虑自己的得失安危而不前去奔丧的人！”说完，就骑马赶往平城。
回到京城后，因乙浑的所作所为大多不合法制，陆丽多次和他争辩，于是，乙浑又杀了陆丽和穆多侯。殿中尚书拓跋郁图谋诛杀乙浑，也被他所杀。
乙浑被任命为丞相后，更是专制独裁，事无大小都由他决定，很多人被他诛杀。安远将军贾秀掌管吏曹事务，乙浑多次告诉贾秀，要他想办法封自己的妻子为公主，贾秀说：“公主怎么能是异姓的女儿所应该称呼的，我宁肯今日去死，也不可为后世所讥笑。”
乙浑大怒，骂道：“老奴才，死抠门。”正巧侍中拓跋丕控告乙浑谋反，冯太后秘密定策，突然下令逮捕乙浑，把他斩首。随后，北魏由冯太后主持朝政，代皇帝行使职权，她把中书令高允、中书侍郎高闾及贾秀引进中枢机构，共同参与朝政。
此时的北魏收到了刘宋薛安都等人的求救，薛安都把儿子送到北魏充为人质，北魏于是派镇东大将军尉元、孔伯恭等率骑兵一万人，向东支援彭城；派镇西大将军拓跋石、张穷奇向西支援悬瓠；任命薛安都为镇南大将军，常珍奇为平南将军。
兖州刺史申纂向北魏诈降，尉元接受了但暗中严密戒备。北魏军抵达无盐后，申纂关闭城门，登城固守。
薛安都向北魏求救时，毕众敬表示反对，派人到朝廷来请求投降，宋明帝将他任命为兖州刺史。可是毕众敬的儿子在建康，由于牵涉到其他的罪名而被杀。毕众敬听到这个消息，怒气冲天，拔出佩刀猛砍庭柱，说：“我白发苍苍，就这么一个儿子，却不能保全，我怎么还能一个人活着。”
北魏军队抵达瑕丘后，毕众敬便向北魏军投降，尉元派部将占据了他的城池，毕众敬又很后悔，几天不进饮食，可是已经太迟了。尉元长驱直入，驻军在秺（du）县。
淮西七郡的百姓大多不愿意归附北魏，村与村联合向南逃奔，北魏派建安王陆馛宣前来安抚新近归附的地区，百姓中有被军队掠夺为奴婢的，陆馛宣下令全部释放，这些地区的百姓才欢欣鼓舞。
刘勔包围寿阳，从当年年初一直到冬末，无论是进攻还是抵抗，每战告捷，又因为他心肠宽厚而深得将士们的拥护。
寻阳政权灭亡后，明帝命令中书发出诏书，向寿阳守将殷琰招降。蔡兴宗说：“天下已经平定，正是殷琰检讨自己过错的时候，陛下只要亲笔写几行字，安抚宽慰，加以引导，他就可以归降。今天由中书颁发诏书，他一定怀疑不是真的，这不是快速解决问题的方法。”明帝不接受。
殷琰看到诏书后，果然认为是刘勔设下的圈套，不敢投降。杜叔宝严密封锁寻阳政权已经灭亡的消息，凡是传递这些消息的人，立刻杀掉，城防越发坚固。后来，凡是有人出城投降，明帝都让他们到寿阳城下，使他们与城中守军对话，守军终于知道外面的情况，军心开始动摇。
殷琰打算投降北魏，夏侯详劝殷琰说：“外面今天之所以拥护寻阳政权，本意是效忠皇家，如果朝廷有人主持，就应该归附朝廷，怎么可以投向北方！而且现在魏军已经接近淮河，建康官军还不知道我们的意向，如果派使节去表示我们的诚心，他们一定会高兴接纳，岂止是免死而已。”
殷琰于是派夏侯详出城晋见刘勔，夏侯详劝刘勔说：“现在城中军民，虽然知道陷入困境，但仍然固守的缘故，是害怕将军诛杀，因而大家都打算降魏。希望将军不要再攻击，下令赦免他们，那么他们自然没有不相继来降的了。”
刘勔答应了，让夏侯详到寿阳城下，呼唤城中人，转告刘勔的承诺。殷琰于是率领他的部将自行反绑双手，出城投降。刘勔全都加以安抚，不杀一个人，进城之后，对军队严格约束，城中百姓的生命财产没有丝毫损失，寿阳人欢天喜地。
北魏的军队已经到达师水，打算救援被围困的寿阳，听到殷琰已经投降，于是掳掠了义阳的数千人返回。
