区别：
jquery.js是完整的未压缩的jQuery库，文件比较大，一般用于阅读学习源码或修改源码，一般不用于线上项目。
jquery.min.js是由完整版的jQuery库经过压缩得来，压缩后功能与未压缩的完全一样，只是将其中的空白字符、注释、空行等与逻辑无关的内容删除，并进行一些优化。这个版本一般用于网站引用使用，减小文件体积，降低网站流量，提升访问速度等。
一般来讲min把空格注释去掉了，用于开发使用。不带min的用于学习阅读。
min.js是压缩js的压缩版，比js的要小，内容是一样的，js版是源码，可以很容易的更改。
延展阅读：
JQuery是继prototype之后又一个优秀的Javascript库。它是轻量级的js库 ，它兼容CSS3，还兼容各种浏览器（IE 6.0+, FF1.5+, Safari 2.0+, Opera 9.0+），jQuery2.0及后续版本将不再支持IE6/7/8浏览器。jQuery使用户能更方便地处理HTML、events、实现动画效果，并且方便地为网站提供AJAX交互。
jQuery比较大的优势是，它的文档说明很全，而且各种应用也说得很详细，同时还有许多成熟的插件可供选择。jQuery能够使用户的html页面保持代码和html内容分离，也就是说，不用再在html里面插入一堆js来调用命令了，只需要定义id即可。
jQuery是一个兼容多浏览器的javascript库，核心理念是write less,do more。
jQuery是免费、开源的，使用MIT许可协议。jQuery的语法设计可以使开发更加便捷，例如操作文档对象、选择DOM元素、制作动画效果、事件处理、使用Ajax以及其他功能。除此以外，jQuery提供API让开发者编写插件。其模块化的使用方式使开发者可以很轻松的开发出功能强大的静态或动态网页。
