2023-01-21-Lecture09_ThreeDimensionalGenome

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细胞核直径约6μm，核内DNA长2m，所以DNA是强烈压缩的，它的三维空间结构如何？

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Hi-C技术

所有都是基于染色质构象捕获技术（3C）的：
冻住（用福尔马林瞬时固定细胞核染色质）——切开（用过量的限制性内切酶酶切消化染色质 - 蛋白质交联物）——连接（在 DNA 浓度极低而连接酶浓度极高的条件下用连接酶连接消化物），蛋白酶消化交联物以释放出结合的蛋白质，用推测可能有互作的目的片段引物进行普通PCR和定量PCR来确定是否存在相互作用。
近距离连接原理

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CTCF环挤压

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1、循环是动态的，而不是静态的
2、内聚形成逐渐增大的环
3、CTCF定义边界
4、聚合物模拟支持环挤压模型

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