前言
今天说一下如何“上位”～
1.大神橙子牛奶糖已经写得很清楚了，不多写：
https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.html
2.唯一真的要说的就是这个“二分类表型文件phenocc.txt”
只要看过GWAS分析-说人话（2）认识文件名，应该也问题不大
（https://www.jianshu.com/p/343ad060cc99）
就找到对应的列，复制黏贴到1个3列的txt文件处就行（Excel也能做，后面保存成txt就行），
想着都要用linux处理的话，就想多了。
3.如果不想做全基因组范围的，
利用--extract snps.txt 准备基因型文件即可。
（本小结文件格式可以是ped/map或者bed/bim/fam，大神的格式为ped/map，用的是--file），
如使用bed/bim/fam，注意文件是用-bfile 即可
plink --noweb --bfile SNPs --pheno phenocc.txt --epistasis --epi1 1 --out test
后记：
Plink还是挺“银杏”的～
点赞超过100的话才写epistasis的理论东西吧～
