isPrototypeOf

作用：检测一个对象是否是另一个对象的原型。或者说一个对象是否被包含在另一个对象的原型链中

var p = {x:1};//定义一个原型对象
var o = Object.create(p);//使用这个原型创建一个对象
p.isPrototypeOf(o);//=>true：o继承p
Object.prototype.isPrototypeOf(p);//=> true p继承自Object.prototype

以上实例来自与《JavaScript权威指南》，简单解释一下就是每一个JavaScript对象都和原型关联，每一个对象都从原型继承属性。所有通过对象直接量创建的对象都使用Object.prototype作为他们的原型，因此p是继承自Object.prototype，因此在p的原型链中一定存在Object.prototype。
上面还提到了Object.create();该方法创建一个新对象，第一个参数是这个对象的原型，所以上面创建的o对象它的原型就是p；

    function Animal(){
　　　　this.species = "动物";
　};
  var eh = new Animal();
  Animal.prototype.isPrototypeOf(eh)//=>true

以上实例是通过new创建了对象eh，使用构造函数Animal的prototype作为它的原型。

综合上面的两个例子，我们发现在调用isPrototypeOf()的时候有三种方式

p.isPrototypeOf(o);//=>true
Object.prototype.isPrototypeOf(p);
 Animal.prototype.isPrototypeOf(eh)//=>true

总结一下就是：
通过Object.create()创建的对象使用第一个参数作为原型
通过对象直接量的对象使用Object.prototype作为原型
通过new创建的对象使用构造函数的prototype属性作为原型

instanceof

instanceof运算符希望左操作数是一个对象，右操作数标识对象的类。如果左侧对象是右侧类的实例，则表达式返回为true，否则返回false。

var d = new Date();
d instanceof Date;//=>true  d是Date的实例
d instanceof Object;//=>true 所有对象都是Object的实例

当通过instanceof判断一个对象是否是一个类的实例的时候，这个判断也会包含对父类的检测。尽管instanceof的右操作数是构造函数，但计算过程实际是检测了对象的继承关系。

instanceOf与isPrototypeOf简单总结

var d = new Date();
Date.prototype.isPrototypeOf(d);//=>true
d instanceof Date;//=>true

• 如果Date.prototype是d的原型，那么d一定是Date的实例。
• 缺点为无法同对象来获得类型，只能检测对象是否属于类名
• 在多窗口和多框架的子页面的web应用中兼容性不佳。其中一个典型代表就是instanceof操作符不能视为一个可靠的数组检测方法。

hasOwnProperty

检测集合成员的所属关系，判断某个属性是否存在于某个对象中。可以通过in运算符，hasOwnProperty()来完成。

in运算符左侧是属性名，右侧是字符串，如果对象的自由属性或者继承属性中包含这个属性则返回true。
对象的hasOwnProperty()方法用来检测给定的名字是否是对象的自由属性，如果是继承属性则返回false

    function Animal(){}//定义Animal构造函数
    Animal.prototype = {//定义Animal原型
        species:"动物",
        say:function(){
            console.log('i can say word');
        }
    }

    function Cat(name,color){//定义构造函数Cat
　　　　this.name = name;
　　　　this.color = color;
　　}
      var F = function(){};
      F.prototype = Animal.prototype;
      Cat.prototype = new F();
      Cat.prototype.constructor = Cat;//Cat继承Animal 用F空对象作为媒介

      var eh = new Cat('lili','white');//实例化对象

      console.log('say' in eh)//=>true
      console.log('name' in eh)//=>true
      console.log('color' in eh)//=>true
      console.log('species' in eh)=>true

      console.log(eh.hasOwnProperty('say'))=>false  由于say为继承属性  非自有属性
      console.log(eh.hasOwnProperty('species'))=>false 由于species为继承属性  非自有属性
      console.log(eh.hasOwnProperty('name'))=>true
      console.log(eh.hasOwnProperty('color'))=>true

      for(var key in eh){
            console.log(key);
        if(eh.hasOwnProperty(key)){
        console.log(key)    //=>species  say name  color
        }   
      }

参考文档

Javascript面向对象编程（二）：构造函数的继承
[JavaScript权威指南]