首先，氨基酸替代模型是什么我现在还不知道，希望有一天能摸索出来
万事开头难之下载
要挂个梯子https://github.com/ddarriba/prottest3/releases
万事中间难之怎么运行
先准备文件，一个比对后的文件，fasta格式就可以，问题是不能有*，物种名字里不能有空格。我直接把*替代成-了，也不知道这样合理不合理
运行的话直接在Windows上运行了，Linux上搞不明白，jar包双击也运行不了，放弃了
cd到prottest所在目录，输入秘籍
java -jar prottest-3.4.2.jar -i myproject\bat_aa_aligned.fas -all-matrices -all-distributions -threads 2 -o myproject\out.txt
万事结尾难之结果什么意思
看了别人的教程，应该是看BIC的结果，推荐的是JTT+G的组合模型
BIC准则（BIC criterion）又称贝叶斯信息准则，与AIC准则（赤池信息准则）类似，用于模型的选择。
BIC值越小，结果越好
JTT(Jones-Taylor-Thornton)、LG(Le and Gascuel 2008)、WAG(Whelan & Goldman 2001) 都是不同的模型
+G、+I+G是什么还没弄清楚
卑微的打工人熟练的完成了她的工作，希望能早日知道这些东西背后的含义
