RNAss
基因表达与肿瘤干细胞的相关性
肿瘤细胞干细胞越弱
输入文件
- RNA肿瘤干细胞打分文件，打分越接近1，干细胞程度越强，分化程度越低
- 表达数据文件
- 需要limma包，corrplot包
遇到了困难，在用t进行转置时，他自动把我的小横线转换成点了，我就研究了好几个小时都不知道咋整，看果子的帖子说是data.frame和as.data.frame里的参数check.names可是我按照那个介绍改了还是没有纠正我这个错误。。。
好难啊，需要问师兄。
DNAss
由于RNAss遇到了困难，所以DNAss就没做，同是TCGA数据需要转置，我嘤嘤嘤了
药物敏感性
- 下载药物敏感性数据和基因表达数据
- 打分越高就说明对药物越敏感
- 下载数据转录组数据+药物敏感性数据
CellMiner下载ZSCORE和RNAseq
对药物FDA进行筛选，FDA没有认证，没有临床试验的数据都删掉。
临床有实验，FDA有认证的数据保留，得到矩阵，行名为药物名称，列名为样品名称
表达数据表格整理：改表头，只保留样品名称，把数据复制到txt内
这个很顺利
