如何在linux系统安装软件

思维导图

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安装linux系统的app store--miniconda

1、下载miniconda

登录服务器，输入uname -a查看服务器多少位。
进入清华镜像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/，选择适合你的系统和服务器位数，注意要选择最新版latest，右键复制下载链接。
在linux界面进入自己想要安装miniconda的目录，然后输入wget 刚才的下载链接，等待下载完成。

2、安装miniconda

（如果进行下去，失败了，需要从这里重来）

输入bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh，中间会出现很多授权信息，一直按回车，直到出现“Do you accept the license terms? [yes|no]”，输入yes，然后开始安装。直到出现“Thank you for installing Miniconda3！”，说明安装成功。教训：如果安装失败，可以删除Miniconda3的目录之后（删除目录和删除文件的代码不一样），回到刚才的步骤重新安装。

3、激活miniconda

输入source ~/.bashrc激活miniconda，命令行输入conda如果有大量信息出现则说明激活成功，如果报错，需要重新安装miniconda，回到刚才的地方。

4、添加镜像

输入下面的代码

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

安装完成后，开始正式使用conda

conda list --显示服务器安装的所有软件
conda search 软件名 --使用conda搜索软件

以数据质控软件fastqc为例，conda search fastqc搜索fastqc软件，conda install fastqc -y安装fastqc软件（-y是yes，安装过程中conda问你的问题全部回答yes）。
卸载软件，输入conda remove fastqc -y