所有活着的人类，都是海里一条巨大的鱼；出生的时候他们从海的此岸出发。他们的生命就像横越大海，有时相遇，有时分开……死的时候，他们便到了彼岸，各去各的世界。
四十五亿年前，这个星球上，只有一片汪洋大海，和一群古老的大鱼。在与人类世界平行的空间里，生活着一个规规矩矩、遵守秩序的族群，他们为神工作，掌管世界万物运行规律，也掌管人类的灵魂。他们的天空与人类世界的大海相连。他们既不是神，也不是人，他们是“其他人”。
十六岁生日那天，居住在“神之围楼”里的一个名叫椿的女孩变作一条海豚到人间巡礼，被大海中的一张网困住，一个人类男孩因为救她而落入深海旋涡死去。为了报恩，让男孩复活，她需要在自己的世界里，历经种种困难与阻碍，帮助死后男孩的灵魂——鲲，一条拇指那么大的小鱼，成长为一条比鲸更巨大的鱼并回归大海，回归人类世界。
为此，椿付出了惨重的代价。
她为了心中的执念，一意孤行、背叛家园、辜负父母、也伤害了湫。一个愿意为她付出自由和生命的男孩。殊不知这一切都是灵婆的阴谋。灵婆利用了每个人心中的贪嗔痴，最终夺取了他想要的自由。椿却为了报恩，继而失去了疼她爱她的爷爷奶奶，也险些失去了赖以生存的家园，最后永远地失去了湫。
而这一切，都值得吗？
影片给出的答案是：值得。
椿的爷爷对她说：只要你的心是善良的，对错都是别人的事。
片头有这样一段旁白：每个人都一样，吃饭、睡觉、喝水……在集体中，我们都是一样的面目，一样的动作，一样溶解在人群中找不到自己的身份，最终泯然众人……其实，我们生活在和椿一样的世界里，从小便知自己是集体的一份子，因此不能有越距的行为，不能有鲜明的个性，不能有过分的要求，事事都要顾及他人的感受，不能因为自己的特立独行而干扰甚至伤害到别人……慢慢的，我们每个人都变成了面目一样的人，被规矩和纪律束缚，做着所有人都在做的事，演着所有人都在演的戏。
所以，当椿一意孤行、义无反顾地决定用自己的一半寿命换回鲲的灵魂时，理所当然遭到了族群所有人的反对。在她的年龄，还不知道很多事情并非偶然，也永远看不到在背后推波助澜的人，灵婆和鼠婆才不会告诉她这样做的后果对于他们整个族群来说是毁灭性的打击，等她发现时，为时已晚。可椿并不后悔，她用自己的生命忍受无尽的痛苦，水击三千里，传扶摇而上九万里，翻倒乾坤，拯救了整个家园。也履行了自己的诺言，把鲲送回了人间。
这一切，只因她觉得值得。
可是，有一点她没弄明白，为什么她会死而复生？难道真是因为自己的善举感动了上苍、感化了天神？在她转身前往南冥天池的时候，灵婆说了这样一句话：不要感谢我，你真正要感谢的应该是那个为你付出生命的人。当然，灵婆不会让椿听到，而他却把鲲和椿命运捆绑的事告诉了湫，只有湫一个人知道，一旦鲲回到人间离开了椿，椿将会立刻死去。
那么故事的结局想必你已经猜到了，湫用自己的生命把椿也送去了人间，并安排了她和鲲的再次相遇，而自己的躯体却化作成无数的残叶散落在人间，化作秋风、化作秋雨，永远陪伴在椿的身旁。灵婆收回了湫的灵魂，让他接替了自己寂寞孤独、暗无天日的工作。
这部影片的引子《逍遥游》里说道：楚之南有冥灵者，以五百岁为春，五百岁为秋；上古有大椿者，以八千岁为春，八千岁为秋。湫用自己八千年的自由与死神达成契约，换回了爱人的生命，也让椿真真切切明白了他的用心。
你问他，这一切都值得吗？
他的答案是：值得。
因为湫说过：“你知道吗？我从小没有爸妈，奶奶一个人把我带大，吃了很多苦，从小就没人管我，天不怕地不怕，想干什么干什么，可在世上我最怕的，就是让我爱的人受苦……”
是执着是洒脱，留给别人去说。人生本就是一场旅程。我们经历了几次轮回，才换来这趟旅程。而这趟旅程却很短，因此不妨大胆一些，去爱一个人，去攀一座山，去追一个梦……有很多事虽然不明白，但我相信一件事。上天让我们来到这个世界上，就是为了让我们创造奇迹。平凡固然可贵，勇敢做自己也许会更好。
