Varona1999预测亲本显性组合

Varona, L., and Misztal, I. 1999. Prediction of Parental Dominance Combinations for Planned Matings, Methodology, and Simulation Results. J. Dairy Sci. 82(10): 2186–2191. Elsevier. doi:10.3168/jds.S0022-0302(99)75463-9.

优势信息的最佳使用需要一个交配系统,并为每一组准父母预测具体的组合能力。目前的评估程序仅为有限的父母提供这样的预测。描述一个程序,预测任何父母的具体组合能力。在这个过程中,对于每一组父母及其祖先,加性关系矩阵被创建为一个密集矩阵。然后使用该矩阵以稀疏矩阵形式创建父母优势矩阵,其中矩阵的行对应于已经可用的预测的所有父母组合。每一个新的预测都需要方程组解的方程组,左边是父母优势矩阵。在一个模拟研究中评估了占优势的交配系统的效率。模拟的数据文件在所选择的男性和女性的比例,通过胚胎移植产生的牛的比例以及加性和显性方差中变化。父本和父母只是基于附加的优点而被预先选定的,但是基于组合的加和优势优势来安排具体的交配。考虑到优势的选择响应从一代添加剂选择的响应从3.8增加到16.6%。当加性方差较小时,显性方差较大,加性选择强度较低,全同胞比例较大。在交配系统中使用优势是可行的,并导致对选择的额外遗传响应。 (关键词:优势,遗传反应,交配系统)

介绍

数量性状的遗传变异可以分为加性和非加性效应(5)。在传统的选择方案中,加性的选择被用来改善家畜生产,选择的方法通常是基于BLUP(8)。在目前用于选择的模型中,非加性变异被忽略,因为在模型中包括这些效应的大计算需求,没有非加性遗传变异的证据,以及非加性关系的低发生率。
优势可以在选择模型中考虑。 Hoeschele和​​VanRaden(10)开发了一个程序,以相对较低的成本直接创建优势关系矩阵的逆矩阵。 Misztal(12)制定了计算优势解决方案的程序,其费用低于附加遗传评估的两倍。该过程与方法R(14)一起允许估计大数据集中的优势变异。随后的研究估计,在奶牛(13),肉牛(6)和猪(3)的类型和生产性状的表型变异的4%到12%处存在显性差异。在模型中包含显性可以提供对模型加性效应评估的边际改善(1,15),并允许通过使用特定组合能力的预测来选择个体之间的交配(4)。
组合能力的选择需要预测种群中所有可能父母的亲本组合。然而,根据目前的评估程序,只有与数据直接相关的父母组合是可用的(10,12)。这项研究的第一个目标是开发一个程序来预测以前计算的父母组合。
选择组合能力的增益取决于优势和其他方差,群体结构和选择强度。这种收益已经用父系模型(4)进行了研究,但与动物模型无关。第二个目标是通过用动物模型进行模拟来评估遗传反应的潜在增益。

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