铁死亡发现之旅:一炮双响,《Nature》预热,《Cell》扬名!

铁死亡作为一种新的细胞死亡形式,近年来颇受研究人员的追捧。我们拟出一期专题,细细梳理铁死亡的前世今生,以期加深大家对铁死亡的了解

铁死亡这一概念来自2012年一篇Cell文章Ferroptosis: an iron-dependent form of nonapoptotic cell death

这是铁死亡以“Ferroptosis”的名义首次公开亮相。实际上,铁死亡的“诞生”可以追溯更早时间

今天,我们结合作者(Brent R Stockwell)发文,来了解下铁死亡的发现之旅

早在1999年,作者就致力于对分子靶向药物的研究。

分子靶向药物的开发通常有两种策略,一种是将小分子设计成针对某种特定活性位点,从而抑制致癌蛋白的活性;另一种是通过大规模药物筛选,发现针对特定基因的药物。

作者基于第二种策略,通过构建表达RAS工程瘤细胞来筛选靶向RAS的小分子药物,他们在2003年发表于Cancer Cell的文章《Identification of genotype-selective antitumor agents using synthetic lethal chemical screening in engineered human tumor cells

文章介绍到,发现了Erastin可以对表达Small T oncoprotein oncogenic RAS的工程瘤细胞选择性致死,同时指出由Erastin诱发的细胞死亡是一种非凋亡的细胞死亡。

既然如此,能否在这上面做文章呢?答案是肯定的。

2007年作者在Nature上发表文章《RAS–RAF–MEK-dependent oxidative cell death involving voltage-dependent anion channels

证明了Erastin激活一种迅速的氧化型且非凋亡形式的细胞死亡,其作用机制涉及RAS-RAF-MEK信号通路。

为了进一步探究作用机制,作者采用了双管齐下策略:一方面通过药物筛选,寻找抑制Erastin药理作用的化合物;另一方面通过亲和纯化质谱寻找Erastin靶向结合的蛋白。最终发现抗氧化剂可以阻止Erastin诱导的细胞死亡,且Erastin通过线粒体电压依赖性阴离子通道VDAC起作用。

关于这篇Nature文章,笔者认为有以下优点(抛砖引玉,欢迎指正)

1.文章思路清晰:表型-机制-靶点-对靶点多角度验证

2.标新立异:拒绝RAS-RAF-MEK通路上反复纠缠,着眼于Erastin和VDAC间的联系。不是说RAS-RAF-MEK不好,而是研究比较烂熟,难以出彩,后者显然新颖度更高。

3.突出卖点:非凋亡性细胞死亡

微瑕之处:

1.Figure并不精美

2.未阐明深刻的调控机制:尽管证明了这种非凋亡性细胞死亡与RAS-RAF-MEK和VDAC相关,但更细致的调控机制不清(类似凋亡的程序化调控机制:通过外源或内源性途径激活Caspase级联反应,切割细胞内关键蛋白,最终导致细胞结构和功能崩解,这种细致程序化机制)

瑕不掩瑜,总体来说四个字评价,大巧不工

科研永不止步,有了上述发现,作者在后续的研究中将更多的精力聚焦在非凋亡性细胞死亡上,由于Erastin药物是在携带RAS的工程瘤细胞中筛选得到。

作者沿袭这一策略,发现了另一化合物RSL3,并发表文章《Synthetic Lethal Screening Identifies Compounds Activating Iron Dependent, Nonapoptotic Cell Death in Oncogenic RAS Harboring Cancer Cells》

作者介绍到,与筛选Erastin相比,他们改进了工程瘤细胞的构建体系,采用了更加新颖小分子药物库,筛选到两种小分子RSL3RSL5,与前期工作类似,他们用筛选出能抑制RSL3和RSL5对细胞杀伤的小分子,发现半胱天冬氨酸酶抑制剂(z-VAD-fmk,Boc-D-fmk为常用的凋亡抑制剂无法有效抑制RSL3和RSL5对细胞的杀伤作用,说明RSL3和RSL5诱导的细胞死亡是非凋亡性的。

RAS信号通路的上游调节剂SRC激酶抑制剂(SU6656)和MEK1/2 抑制剂 (U0126)能阻断RSL3和RSL5诱导的细胞死亡,其他RAS下游信号阻断剂PI3K抑制剂(wortmannin),mTOR抑制剂(雷帕霉素)和MAPK抑制剂(SB203580)均对RSL5和RSL3无阻断作用,表明是RAS-RAF-MEK 依赖性,而非其他RAS下游信号。RAS信号参与铁转运相关基因如TfR1, FTH,  FTL的调控,作者也同样进行了验证。

另外,还发现铁螯合剂抗氧化剂能够抑制RSL3和RSL5诱导的细胞死亡,表明是铁依赖性氧化

由于在Erastin的研究中发现VDAC是重要的靶点,作者进一步验证VDAC是否同样作为RSL3和RSL5的重要靶点。有趣的是,作者发现RSL5发挥致死作用依赖VDAC,而RSL3独立于VDAC发挥作用,暗示这些化合物靶向的氧化、非凋亡细胞死亡途径不局限于VDAC 的参与,很可能在其他条件下也被激活。

至此,由Erastin,RSL3和RSL5诱导的基于 RAS-RAF-MEK信号通路的铁离子依赖,氧化性的非凋亡细胞死亡主体特征基本呈现。这部分工作作者发表在Chemistry & biology,影响因子并不高。当然喽,故事到这里并没有结束,在2012年,作者在Cell杂志上正式提出了铁死亡,《Ferroptosis: An Iron-Dependent Form of Non-Apoptotic Cell Death

作者在文章中介绍到,Ras突变在肿瘤中约占30%,他们鉴定出两种结构不相关,但对Ras突变细胞有选择性致死作用的药物Erastin和RSL3。有意思的是,作者发现这两种药物诱导的细胞死亡并不具备凋亡特征,而是由铁离子依赖,脂质过氧化驱动的新型细胞死亡形式。文章对前期工作进行了总结并升华,仔细阅读,我们会发现作者思路中非常巧妙的地方。限于篇幅,我们下期接着聊。

参考文献:

1.Dixon, S. J.;  Lemberg, K. M.;  Lamprecht, M. R.;  Skouta, R.;  Zaitsev, E. M.;  Gleason, C. E.;  Patel, D. N.;  Bauer, A. J.;  Cantley, A. M.;  Yang, W. S.;  Morrison, B., 3rd; Stockwell, B. R., Ferroptosis: an iron-dependent form of nonapoptotic cell death. Cell 2012, 149 (5), 1060-72.

2.Dolma, S.;  Lessnick, S. L.;  Hahn, W. C.; Stockwell, B. R., Identification of genotype-selective antitumor agents using synthetic lethal chemical screening in engineered human tumor cells. Cancer Cell 2003, 3 (3), 285-96.

3.Yang, W. S.; Stockwell, B. R., Synthetic lethal screening identifies compounds activating iron-dependent, nonapoptotic cell death in oncogenic-RAS-harboring cancer cells. Chem. Biol. 2008, 15 (3), 234-45.

4.Yagoda, N.;  von Rechenberg, M.;  Zaganjor, E.;  Bauer, A. J.;  Yang, W. S.;  Fridman, D. J.;  Wolpaw, A. J.;  Smukste, I.;  Peltier, J. M.;  Boniface, J. J.;  Smith, R.;  Lessnick, S. L.;  Sahasrabudhe, S.; Stockwell, B. R., RAS-RAF-MEK-dependent oxidative cell death involving voltage-dependent anion channels. Nature 2007, 447 (7146), 864-8.

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