生信学习Day3-linux环境安装软件

今天继续学习Linux相关操作——安装软件。

1. 下载miniconda.

百度搜索“miniconda 清华”,或者直接由以下链接进入https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/。根据自己的服务器,选择合适的版本下载即可。
在linux中输入命令 wget+复制好的下载链接,开始下载。

2. 安装并配置miniconda

安装

通过【bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh】开始安装。
安装过程中通过“enter”或者“yes”继续进行。
当看到“Thank you for installing miniconda3”表示安装成功。

激活

通过【source~/.bashrc】来激活conda.当输入“conda”命令时没出现满屏信息即表明成功了。

添加镜像

将代码复制到命令行,粘贴并回车。

3. miniconda的使用

-conda list: 查看当前服务器上安装的所有软件列表
-conda search fastqc: 搜索conda软件
-conda install fastqc -y: 安装软件。安装过程中,所有问题都回答yes。
-conda remove fastqc -y: 卸载软件。

4. conda环境

conda环境是指为满足不同的项目需求,所安装的不同软件。【仅作了解】

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