前面给大家简单介绍了如何用☞R绘制堆积柱形图,今天我们来看看如何用ggplot2这个包来绘制堆积柱形图。我们还是使用☞R绘制堆积柱形图中用到的all_pool_species_sample.txt这套数据。数据的格式如下
利用ggplot绘制堆积柱形图,需要对数据格式进行转换
library(ggplot2)
raw=read.table("sample_bacteria_percentage.txt",header=T,sep="\t")
library("reshape2")
data=melt(raw,id="class")
转换之后的数据格式如下
我们先用默认参数来画一张图看看
p=ggplot(data, aes(x=variable, y=value,fill=class)) +
geom_bar(stat="identity",position = "stack")
p
这张图虽然能反应我们的数据,但是总觉得不是太美观。
1)字体有点小
2)不想要灰色背景
3)横轴标签variable和纵轴标签value可以不显示
接下来我们就来解决这几个问题
p+theme(
text = element_text(size=20), #所有字体大小为20
axis.text.x = element_text(angle=90, vjust = 0.5), #X轴文字90度摆放,水平微调0.5
axis.title.x=element_blank(), #删除X轴标题
axis.title.y=element_blank(), #删除Y轴标题
panel.background = element_blank() #删除灰色背景
)