有的人认为眼睛的存在就能推翻进化论，说眼睛的结构太过复杂，不可能是进化出来的。但是他们似乎是只了解到人类眼睛的结构特点，并想当然的以为这种复杂的器官结构是一次性形成的，这其实是一种很无知的言论。
诚然，人类的眼睛具备极高的复杂性，但是人类的眼睛结构并不是自然界各种动物视觉器官的唯一解，这个我们从各种昆虫身上就能看出来。动物眼睛其实有很多不同的类型，有涡虫的单眼，有泛节肢动物的复眼，有软体动物的杯型眼，有鹦鹉螺那样的小孔成像眼，也有脊椎动物的晶状体眼。我们完全可以通过对不同类型眼睛结构的对比，从而推导出一个近乎完整的眼睛的演化过程。
现代科学家已经通过对化石的对比，以及现有动物的类似结构的分析成功还原了一个眼睛的演化路径，这个过程完全符合我们常规认知中进化论的从简单到复杂的概念。眼睛的演化与各种动物的演化过程近乎是同步的，这也证明了动物正是通过对环境的适应而不断筛选出更加优质的个体，以达到将自己的血脉成功的流传下来的目的。
很多人对于基因变异的理解存在严重的错误，他们以为突变就像畸形，他们理解的基因突变是那种突然长出第三条腿这样的情况。生物的基因变异无时不刻都在发生，与拉马克用进废退理论不同的是，生物的DNA存在着用退废进的状况。细胞的每一次分裂都有可能发生一次或者两次DNA复制的错误，随着分裂的不断进行，基因就会发生细微的改变，这才是生物最常见的基因变异。其实绝大多数基因变异都是无效的变异，并不会很直观的展现在动物的外表上，但是简单的细微的变化会随着动物一代代的繁殖而发生累加，并对动物在生存中的某一个方向的能力造成细微的改变。这些细微的改变乘以动物庞大的数量和漫长的演化时间后就会叠加成翻天覆地的变化。
生物的变异累加到一定程度的时候，起所产生的微小的生存能力上的改变，例如动物运动能力的强弱等，就有可能影响到动物在生存竞争中的成功与否，这就是演化的基本组成。像这种类似的通过变异的累加而产生的生存能力上优劣，会不断推进生物向着不同的方向不断变化，渐渐的就可以产生新的物种。
生物的进化就是由这样的无数次的简单且细微的突变不断地累加而形成的，而不是某些人臆想中的突然间的巨大的变化，这才是自然选择的过程，才是真正的进化。
